Potenciál fenyletanoidových glykozidov z Herba Cistanches proti Oecuar Lyeeanisn

Hepatocelulárny karcinóm: Na základe sieťovej farmakológie a molekulárneho dokovania ZHANG Jiawei', WEN Limei? , HU Junping', YANG Jianhua? (1 College of Pharmaceutical Sciences, Xinjang Medical University, Urumqi 830054, Čína; 2 Department of Pharmacy, First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University, Urumqi 830011, China)

Abstraktné

Cieľ: Preskúmať potenciálmolekulárny mechanizmus fenyletanoidných glykozidovodHerha Cistanches (CPhGs)proti hepatocelulárnemu karcinómu (HCC) prostredníctvom sieťovej farmakológie a molekulárneho dokovania. Metódy: Aktívne zložky a potenciálne ciele CPhG boli získané z "The Tradičná čínska medicína Systems Pharmacology Database and Analysis Platform ('TCMSP) a iných databáz a literatúry a ciele súvisiace s HCC z "Therapeutic Target Database ('TT), Genecardsand iné databázy. Takto sa získali spoločné ciele CPhG a choroby a vytvorila sa sieť interakcie proteín-proteín (PPl) na skríning kľúčových cieľov. Kľúčové ciele boli importované do DAVlD pre obohatenie génovej ontológie (GO) a obohatenie dráhy Kjótskej encyklopédie génov a genómov (KEGG). Nakoniec sa AutoDock vina použil na molekulárne dokovanie hlavných aktívnych zložiek a hlavných cieľov. Výsledky: Celkovo sa vyšetrilo 29 aktívnych zložiek v CPhG, ktoré zahŕňali 410 cieľových génov. Signálne dráhy priamo súvisiace s liečbou HCC bolisignálna dráha rakoviny, rakovinový proteoglykán. signálna dráha fosfatidylinozitol 3-kináza-proteín kináza B ( Pl3K-Akt ), signálna dráha vaskulárneho endotelového rastového faktora (VEGF) atď. účinných látok. Záver: CPhG môžu regulovať rakovinové bunky, angiogenézu a iné prostredníctvom viacerých zložiek, viacerých cieľov a viacerých dráh, čím majú terapeutické účinky na HCC.

Kľúčové slová ; Hepatocelulárny karcinóm; Sieťová farmakológia; molekulárny dok.kráľ,cistanche

CISTANCHE EXTRAKT PREOCHRANA PEČENE

Primárna rakovina pečener patrí vo svete medzi zhubné nádory s vysokou morbiditou a mortalitou a miera prežitia do 5 rokov je len 7 % [1]. Hepatocelulárny karcinóm (HCC) je najvýznamnejším patologickým typom, ktorý tvorí viac ako 85 % [2]. Najnovšie údaje ukazujú, že úmrtnosť a miera výskytu HCC v mojej krajine sú na treťom a štvrtom mieste medzi všetkými malígnymi nádormi a vyznačuje sa rýchlym vývojom a ľahkou recidívou [3-4]. Etiológia a patogenéza rakoviny pečene sú stále nejasné. Jeho výskyt môže súvisieť s polymorfizmami hostiteľského génu, environmentálnymi faktormi (vrátane metabolického syndrómu a aflatoxínu B1), konzumáciou alkoholu a vírusovými faktormi (vrátane infekcie vírusom hepatitídy B a hepatitídy C). ) súvisiace s interakciou [5]. Tradičná čínska medicína sa môže použiť u pacientov s pokročilým HCC a má protinádorové účinky, znižuje nežiaduce reakcie rádioterapie a chemoterapie, zlepšuje imunitu pacientov s nádorom a zlepšuje kvalitu života [6]. Cistanche deserticola je druh rastliny Orobanchiaceae Cistanche cistanche Cistanche deserticolaY. C. Ma alebo Cistanche tuberosum Cistanche Cistanche. CHE TUBULOSA (SCHENK)

Sušené dužinaté stonky so šupinatými listami Wight [7] majú funkcievyživovanie obličiek, dopĺňajúca esencia, a zvlhčovanie

Má vysušujúci a laxatívny účinok. Je to vzácny a cenný tonizujúci liečivý materiál jedinečný pre suché oblasti severozápadu mojej krajiny a má dlhú históriu používania. Cistanche deserticola bola prvýkrát zaznamenaná vo východnej dynastii Han "Shen Nong's Materia Medica": "Chutí sladko a mierne teplo. Lieči päť druhov pôrodu a sedem poranení. Vyživuje stred, odstraňuje chlad, teplo a bolesť v stonkách , vyživuje päť vnútorných orgánov, posilňuje jin, dopĺňa esenciu a čchi a pomáha pri pôrode a ženskom syndróme „Dlhodobé užívanie odľahčí telo“ a je klasifikovaný ako top grade [8] celkové fenyletanoidové glykozidy (. Pheny⁃

Lethanoidové glykozidy z Cistanche, CPhGs) ako cistanches Medzi hlavné účinné látky v ňom patria verbaskozid, echinaceazid, salidrozid, 2′-acetyl verbaskozid, tubulín B atď. [9], má funkcie ochrany pečene, proti demencii, proti únave, proti ischémii, proti osteoporóze, laxatíve, imunitnej regulácii, proti starnutiu a na zlepšenie reprodukcie [10].

Štúdie preukázali, že CPhG majú dobrý účinok pri prevencii a liečbe rakoviny pečene. Výskum Yuana a kol. [11] ukázali, že CPhG inhibujú rast buniek H22 prostredníctvom exogénnych a endogénnych dráh apoptózy. Hu Qiong a kol. [12] zistili, že CPhG môžu inhibovať rast buniek rakoviny pečene, čo môže súvisieť s tým, že CPhG znižujú obsah AFP v sére myší s nádorom a zlepšujú imunitu myší s nádorom. V súčasnosti neexistuje žiadna hĺbková štúdia o úlohe CPhG pri prevencii a liečbe HCC a jeho molekulárnom mechanizme účinku a jeho aktívne zložky, ciele pôsobenia a molekulárne mechanizmy ešte nie sú úplne objasnené.

Sieťová farmakológia aktualizuje existujúci prístup „jeden cieľ, jeden liek“ na výskumný prístup „sieťový cieľ – viaczložkový“, to znamená, že na tomto základe vykonáva komplexnú analýzu účinnosti tradičnej čínskej medicíny a skúma tradičnú čínsku medicínu. zo systémového hľadiska a na molekulárnej úrovni. , ktorá vytvára nové nápady pre sieťovú farmakológiu tradičnej čínskej medicíny [13-14]. Táto štúdia využíva sieťové farmakologické stratégie a je založená na holistickom pohľade tradičnej čínskej medicíny na systematické skúmanie mechanizmu účinku CPhG pri prevencii a liečbe HCC. V kombinácii s viacúrovňovým sieťovým modelom „TCM⁃aktívne zložky⁃cieľové⁃signalizačné dráhy“ sa predpokladá účinnosť CPhG pri prevencii a liečbe HCC. Kľúčové ciele a mechanizmy pôsobenia boli overené pomocou technológie molekulárneho dokovania a bol vypracovaný synergický mechanizmus viaczložkových, viaccieľových a viaccestných dráh CPhG, čo výrazne zlepšilo oblasť rozvoja liečivých zdrojov CPhG a poskytlo odkaz pre ďalší výskum.

1 Materiály a metódy

1.1 Zbierka komponentov CPhG

Vyhľadávaním v databáze a analytickej platforme farmakológie systému tradičnej čínskej medicíny (Farmakologická databáza a analytická platforma tradičnej čínskej farmakológie, TCM SP), v databáze encyklopédie tradičnej čínskej medicíny (Encyklopédia tradičnej čínskej medicíny) divine, ETCM), v komplexnej databáze tradičnej čínskej medicíny (Tradičná čínska medicína I Tornádo

základňa, TCCMID) a iné databázy a kombinované s údajmi národnej znalostnej infraštruktúry

Databáza (China National Knowledge Infrastructure, C Príslušná literatúra v databázach NKI a PubMed bola použitá na zhromaždenie informácií o chemickom zložení a cieľových informáciách CPhG. Prostredníctvom vyhľadávania v databázach TCMSP, ETCM, TCMID a literatúre sa nakoniec identifikovalo 29 zlúčenín.

Ako kandidátske zlúčeniny [15-16].

1.2 Predikcia potenciálnych terapeutických cieľov liekov a konštrukcia sieťového diagramu „TCM-Active Ingredient-Target“

Súbory vo formáte SDF získaných komponentov boli importované do databázy PharmMapper na vykonanie prediktívnej analýzy potenciálnych cieľov a na opravu názvov cieľov sa použila funkcia vyhľadávania UniProt KB. Softvér Cytoscape 3. 8. 0 bol použitý na zostavenie sieťového diagramu „TCM-Active Ingredient-Target“.

1.3 Skríning génov súvisiacich s HCC

Ak chcete získať informácie o cieli HCC, použite ako kľúčové slová „Hepatocelulárny karcinóm“ a „HCC“ na vyhľadávanie v nasledujúcich 4 databázach: 1) databáza O MIM; 2) databáza DrugBank; 3) databáza GeneCards; 4) Terapeutická cieľová databáza (Therapeutic Target Database, TTD, http://db.i drlab.net/ttd). Po skríningu sú cieľové informácie zhrnuté a usporiadané.

1. 4 Cieľové mapovanie CPhG na liečbu HCC

Na vytvorenie Waynetu cez online kresliaci softvér je cieľ komponentu CPHGS mapovaný s cieľom HCC. Cieľ križovatky je potenciálnym cieľom kategórie HCC komponentu CPHGS. Ciele priesečníkov chorôb.

1. 5. Konštrukcia proteínovej ５ proteínovej interakcie

(PROTEIN⁃PROTEIN Intere⁃ACTION, PPI) the network uses the STRING database: / / / / sTRING⁃DB. ORG /) for PPI analysis of the target. Set the COMBI NED SCORE>{{0}}. 4 a použite Cytoscape 3. 8. 0 na vykonanie topologickej analýzy výsledkov a vylúčenie kľúčových zdieľaných cieľov s hodnotou stupňa väčšou ako 2-násobok mediánu.

1.6 Analýza obohatenia génovej ontológie (GO) a analýza obohatenia Kjótskej encyklopédie génov a genómov (Kjótska encyklopédia) okrem iného génov a genómov, KEGG

Databáza DAVID sa použila na vykonanie analýzy GO a analýzy obohatenia dráhy KEGG na cieľových proteínoch, s ktorými CPhG a HCC spoločne interagovali, a prah P Menší alebo rovný {{0}}.05 bol nastavený na skríning vyberte biologické procesy a dráhy s významnými rozdielmi a použite Cy⁃ na ｓｃａｐｅ 3. 8.0 Softvér vytvára sieť „TCM⁃Active Ingredients⁃Targets⁃Pathway“.

1.7 Overenie molekulárneho dokovania základných cieľov Vyberte kľúčové cieľové proteíny

Biela bola použitá na molekulárne dokovanie. Súbory kryštálovej štruktúry týchto cieľových proteínov boli získané z databázy RCSBPDB. Štruktúrne súbory aktívnych zložiek týchto cieľov boli získané z databázy PubChem. Softvér Autododock{0}}vina sa použil na výpočet vzťahu medzi cieľovými proteínmi a najnižšou väzbovou energiou medzi aktívnymi zložkami a bude vizualizovať výsledky verifikácie simulácie molekulového dokovania.