Úloha alternatívneho spájania pri regulácii reakcie hostiteľa na vírusovú infekciu

Sep 15, 2023

Abstraktné: Význam transkripčnej regulácie hostiteľských génov vo vrodenej imunite proti vírusovej infekcii bol široko uznávaný. Nedávno získali post-transkripčné regulačné mechanizmy uznanie ako ďalšia a dôležitá vrstva regulácie na doladenie imunitných reakcií hostiteľa. Tu uvádzame funkčný význam alternatívneho zostrihu vo vrodených imunitných odpovediach na vírusovú infekciu. Opisujeme, ako niekoľko centrálnych zložiek interferónových dráh typu I a III kóduje zostrihané izoformy na reguláciu aktivácie a funkcie IFN. Okrem toho sa diskutuje o funkčných úlohách zostrihových faktorov a modulátorov v antivírusovej imunite. Nakoniec diskutujeme o tom, ako sú dráhy bunkovej smrti regulované alternatívnym zostrihom, ako aj o potenciálnej úlohe tejto regulácie na imunitu hostiteľa a vírusovú infekciu. Celkovo tieto štúdie zdôrazňujú dôležitosť zostrihu RNA pri regulácii interakcií hostiteľ-vírus a naznačujú úlohu pri znižovaní antivírusovej vrodenej imunity; to môže byť rozhodujúce pre prevenciu patologického zápalu.

Kľúčové slová: alternatívne spájanie; antivírusová odpoveď; vrodená imunita; cesty bunkovej smrti

Desert ginseng—Improve immunity (22)

Výhody doplnku cistanche-ako posilniť imunitný systém

1. Úvod

Reakcia hostiteľa na vírusovú infekciu je mnohostranná a zahŕňa indukciu antivírusového transkripčného programu vrátane expresie interferónov (IFN) a cytokínov a aktiváciu dráh bunkovej smrti (apoptóza, nekroptóza a pyroptóza). Medzi týmito cestami je veľa krokov prísne regulovaných na niekoľkých úrovniach, aby sa zabezpečila homeostáza tkaniva. V tomto prehľade diskutujeme o funkčných úlohách alternatívneho zostrihu a rôznych zostrihaných izoforiem pri formovaní imunity hostiteľa proti vírusovej infekcii. Zostrih pre-messenger RNA je dôležitým krokom dozrievania RNA, ktorý zahŕňa spojenie exónov a odstránenie intrónov. Prevažná väčšina transkriptov produkovaných RNA polymerázou II (RNAP II), vrátane väčšiny mRNA, obsahuje intróny, a preto musia byť zostrihané. Zostrih sa uskutočňuje v bunkových jadrách jedným z dvoch makromolekulárnych ribonukleoproteínových komplexov, známych ako hlavný a vedľajší spliceozóm [1]. Odhaduje sa, že viac ako 90 % exprimovaných ľudských génov podlieha alternatívnemu zostrihu (AS) [2], čo umožňuje jednotlivým génom generovať viacero odlišných mRNA, ktoré môžu kódovať odlišné proteíny, čím sa značne rozširuje komplexnosť proteómu. Bolo opísaných mnoho typov AS udalostí a primárne zahŕňajú kazetové exóny, vzájomne sa vylučujúce exóny, alternatívne použitie 50 zostrihových miest, alternatívne použitie 30 zostrihových miest a retenciu intrónov. Keďže udalosti môžu byť regulované časovo-priestorovo závislým spôsobom [1] kombinovaným pôsobením cis-elementov (napr. zosilňovačov zostrihu exónu (ESE)) a trans-faktorov (napr. proteínov viažucich RNA) [3]. Aberantný zostrih je spojený s mnohými chorobami [4,5], čo ešte viac podčiarkuje dôležitosť tohto vysoko regulovaného procesu. Izoformy AS a mRNA hrajú dôležité úlohy prakticky vo všetkých bunkových procesoch a dráhach, a preto nie je prekvapujúce, že obe boli zaznamenané ako kritické pre účinnú antivírusovú odpoveď.

Cistanche deserticola—improve immunity   -

cistanche tubulosa - zlepšenie imunitného systému

2. Alternatívny zostrih RNA a jej izoformy v odpovediach IFN typu I a III

Antivírusová odpoveď sa spustí, keď receptory na rozpoznávanie bunkových vzorov (PRR) detegujú molekulové vzory spojené s patogénom (PAMP). Gén I indukovateľný cytosolovou kyselinou retinovou (RIG-I) a proteín 5 spojený s diferenciáciou melanómu (MDA-5) snímajú dvojvláknovú RNA (dsRNA) (RIG-I špecificky deteguje 50 -trifosfát alebo {{8} }}difosfát molekúl RNA) a podstupujú konformačné zmeny, aby sa spojili s downstream mitochondriálnym antivírusovým signálnym proteínom (MAVS). Následne sa MAVS spája s TANK Binding Kinase 1 (TBK1) a I-kappa-B kinázou epsilon (IKKε), čím podporuje fosforyláciu interferónového regulačného faktora 3 (IRF3) a interferónového regulačného faktora 7 (IRF7). Tieto dva transkripčné faktory sa translokujú do jadra a riadia transkripciu a produkciu mRNA interferónu typu I a typu III (IFN). Cytosolický DNA senzor, cyklická GMP-AMP syntáza (cGAS), dokáže detekovať DNA v cytoplazme ako PAMP, keď DNA vírusy infikujú bunky a produkujú cyklický dinukleotid 20,30 -cyklický GMP–AMP (20,{21 }}cGAMP) [6]. Tento sekundárny posol následne aktivuje ER-rezidentný stimulátor interferónových génov (STING) a vedie k TBK1-závislej fosforylácii IRF3 pre produkciu IFN typu I a III. Je dôležité poznamenať, že cGAS bolo preukázané, že tiež reaguje na infekciu RNA vírusom, pravdepodobne v dôsledku cytoplazmatického uvoľnenia mitochondriálnej DNA hostiteľa [7]. Okrem toho môže membránovo viazaný Toll-like receptor 3 (TLR3) rozpoznať dsRNA v endozomálnych kompartmentoch. Detekcia ligandu pomocou TLR3 spúšťa jeho asociáciu s adaptérom interferón-indukujúcim adaptér (TRIF) obsahujúcim doménu TIR a indukuje fosforyláciu IRF3 závislú od TBK1/IKKε. Všetky tieto procesy kulminujú v transkripčnej indukcii génov IFN typu I a III a produkcii týchto IFN (obrázok 1).

Figure 1

Obrázok 1. Alternatívny zostrih v odpovedi hostiteľa IFN typu I a typu III. Izoformy AS, ktoré upregulujú antivírusovú odpoveď, sú zobrazené zelenou farbou a tie, ktoré znižujú antivírusovú odpoveď, sú zobrazené červenou farbou.

Novo syntetizované IFN typu I a III sa vylučujú a aktivujú downstream signalizáciu autokrinne aj parakrinne závislými spôsobmi. Tieto dve triedy IFN sa viažu na rôzne membránové receptory. IFN typu I sa viažu na podjednotky 1 a 2 receptora interferónu alfa a beta (IFNAR1 a IFNAR2), zatiaľ čo IFN typu III využívajú receptor interferónu lambda 1 (IFNLR1) a podjednotku beta receptora interleukínu 10 (IL10-RB) [8 ]. Akonáhle sa tieto receptory naviažu na svoje ligandy, konformačné zmeny získajú intracelulárne kinázy, ktoré následne fosforylujú signálny prevodník a aktivátor transkripcie 1 (STAT1) a signálny prevodník a aktivátor transkripcie 2 (STAT2). Fosforylované STAT1 a STAT2 sa spájajú s interferónovým regulačným faktorom 9 (IRF9) za vzniku komplexu ISGF3, ktorý sa translokuje do jadra a aktivuje stovky IFN-stimulovaných génov (ISG) na vytvorenie bunkového antivírusového stavu. PRR gény kódujú niekoľko zostrihových variantov na reguláciu ich funkcií. Bolo hlásené, že zostrihový variant RIG-I bez exónu 2 je exprimovaný spolu s izoformou plnej dĺžky po liečbe IFN- a infekcii vírusom Sendai (SeV) [9]. Tento zostrihový variant má deléciu vo svojej N-terminálnej CARD doméne a táto delécia bráni RIG-I ubikvitinácii tripartitným motívom obsahujúcim 25 (TRIM25), predpokladom aktivácie RIG-I. V dôsledku toho sa ukázalo, že tento zostrihový variant pôsobí ako dominantná negatívna forma RIG-I. Ektopická expresia tohto zostrihového variantu RIG-I inhibuje transkripciu IFN-indukovanú SeV. Ukázalo sa, že TLR3 má niekoľko izoforiem [10,11]. Izoforma, ktorej chýba transmembránová doména a väčšina pôvodnej intracelulárnej domény TIR, hrá inhibičnú úlohu v odpovedi IFN [10]. Negatívne regulačné účinky tejto izoformy TLR3 môžu byť spôsobené konkurenciou o väzbu ligandu, pretože táto izoforma TLR3 má väzbové miesta dsRNA, zatiaľ čo jej chýba cytoplazmatická doména TIR potrebná na prenos signálu. Tieto izoformy PRR naznačujú existenciu negatívnej spätnej väzby, ktorá dolaďuje antivírusovú odpoveď IFN. Kľúčové signálne efektorové proteíny po prúde od vírusových senzorov v reakciách typu I a typu III tiež exprimujú rôzne izoformy AS a mnohé z nich pôsobia dominantne negatívnym spôsobom. Boli pozorované viaceré izoformy MAVS: MAVS 1a, 1b a 1c [12]. MAVS la je produkovaný preskočením exónu 2 a kóduje skrátený MAVS v dôsledku predčasného stop kodónu. Tento skrátený proteín má intaktnú N-koncovú doménu CARD a jeho nadmerná expresia blokuje transkripciu IFN, pravdepodobne sekvestráciou proteínov faktora 2 asociovaného s receptorom TNF (TRAF2). MAVS1b, ktorému chýba exón 3, tiež kóduje skrátený proteín predčasným stop kodónom v dôsledku posunu rámca. Tento MAVS1b je však schopný aktivovať transkripciu IFN- a inhibovať replikáciu vírusu vezikulárnej stomatitídy (VSV), čo naznačuje obojsmerný mechanizmus, ktorým je regulovaná aktivita MAVS. Navyše, STING, cGAS downstream efektor, má zostrihnutú izoformu, nazývanú MRP [13]. V porovnaní s STING, MRP neobsahuje exón 7, a teda nemá C-koncovú TBK1 interagujúcu doménu. Ukázalo sa, že MRP môže dimerizovať s STING a blokovať interakciu STING-TBK1. Táto interferencia v asociácii STING-TBK vysvetľuje, prečo MRP inhibuje STING-sprostredkovanú transkripciu IFN-. V súlade s týmto zistením, MRP knock-down znižuje replikáciu VSV, pravdepodobne de-represiou hostiteľských IFN odpovedí. Je zaujímavé, že hoci MRP blokuje signálnu dráhu IFN sprostredkovanú STING indukovanou infekciou SeV, MRP zvyšuje odpoveď IFN vyvolanú vírusom herpes simplex typu 1 (HSV-1). Zdá sa teda, že MRP hrá rôzne úlohy v reakcii na infekcie vírusmi RNA a DNA. TRIF je kritický adaptér pre signálnu dráhu3-spustenú TLR. Zostrihový variant, ktorému chýba centrálna doména TIR, nazývaný TRIS, bol pozorovaný v širokom spektre bunkových línií [14]. Predchádzajúce štúdie ukázali, že TRIF je spojený s TLR3 prostredníctvom ich príslušných domén TIR [15]; preto by sa dalo očakávať, že TRIS-deficientný TRIS bude pôsobiť ako inhibítor signalizácie sprostredkovanej TLR3-. Avšak nadmerná expresia TRIS, aj keď v menšej miere ako TRIF, aktivuje transkripciu IFN- a potlačenie transkripcie IFN-indukovanej poly (I:C) redukovanou TRIS. Tieto výsledky naznačujú prekvapivú, no nie nadbytočnú úlohu TRIS v signalizácii sprostredkovanej TLR3-. Faktor 3 spojený s receptorom tumor nekrotizujúceho faktora (TRAF3) je doplnkovým proteínom v dráhach RIG-I-MAVS a podlieha AS v T-bunkách [16]. Táto udalosť preskočenia exónu 8 v TRAF3 je primárne sprostredkovaná CUGBP ElavLike Family Member 2 (CELF2) a heterogénnymi proteínmi jadrového ribonukleoproteínu C (hnRNP C) [17]. Úlohu tejto AS udalosti v antivírusovej odpovedi hostiteľa však zostáva určiť.

cistanche supplement benefits-increase immunity

výhody doplnku cistanche-zvýšenie imunity

Bolo tiež zistené, že nové zostrihané izoformy TBK1 a IKKε hrajú negatívne regulačné úlohy počas reakcie IFN. TBK1s, zostrihaný transkriptový variant TBK1, nemá exón 3–6, ktorý kóduje doménu serín/treonínkinázy sprostredkúvajúcu fosforyláciu IRF3 a IRF7. Ďalšie funkčné a biochemické testy ukazujú, že TBK1 inhibujú transkripciu IFN- blokovaním interakcie medzi RIG-I a MAVS [18]. Je zaujímavé, že TBK1 nie sú hojne exprimované v neinfikovaných bunkách. Po infekcii SeV, najmä v neskorších časových bodoch, sa expresia TBK1 stáva výraznejšou. Táto oneskorená upregulácia naznačuje, že bunky si vyvinuli stratégiu negatívnej regulácie aktivácie IFN po odstránení vírusovej infekcie. Okrem toho sa pri infekcii vírusom chrípky A (IAV) pozoruje zostrihnutá izoforma, ale jej funkčný význam je potrebné charakterizovať [19]. Pokiaľ ide o IKKε, tento gén exprimuje dva zostrihané varianty, IKKε sv1 a IKKε sv2, ktoré sa líšia v karboxylových oblastiach v porovnaní s IKKε s plnou dĺžkou [20}]. IKKε sv1 aj sv2 tvoria diméry s IKKε s plnou dĺžkou a inhibujú signalizáciu IRF3 indukovanú IKKε s plnou dĺžkou, vrátane jej úlohy pri podpore antivírusovej aktivity. Je zaujímavé, že pri infekcii vírusom dengue (DENV) bola pozorovaná zvýšená regulácia expresie týchto dvoch izoforiem [21], čo naznačuje, že tento flavivírus si vyvinul schopnosť zasahovať do vrodenej imunity reguláciou AS. U cicavcov boli charakterizované viaceré izoformy IRF3 a IRF7. IRF3a je variant IRF3 AS [22,23], ktorý využíva alternatívny exón 3a a produkuje proteín skrátený na N-konci vďaka použitiu odlišného štartovacieho kodónu. IRF3a nemá funkčnú DNA väzbovú doménu, a preto sa nedokáže viazať na IFN- promótor. Preto IRF3a inhibuje transkripčnú aktivitu IRF3 [22]. Druhá zostrihnutá izoforma, IRF3-CL, je transkript odvodený z alternatívneho 30 miesta zostrihu, 16 nukleotidov pred exónom 7 hlavného transkriptu IRF3 [24]. IRF3-CL zdieľa N-terminálnu oblasť s IRF3, ale líši sa na C-koncoch. Táto izoforma negatívne reguluje aktivitu IRF3 a je všadeprítomná. Naproti tomu expresia IRF3-nirs3 je obmedzená na špecifické tkanivá [25]. Zdá sa, že táto izoforma je exprimovaná v bunkách ľudského hepatocelulárneho karcinómu, ale nie v primárnych ľudských hepatocytoch. Transkripty IRF-nirs3 neobsahujú exón 6 a toto vylúčenie vedie k proteínu, ktorému chýba centrálna asociačná doména IRF, ktorá je rozhodujúca pre jeho homodimerizáciu alebo heterodimerizáciu s IRF3 alebo inými IRF. Ako sa očakávalo, nadmerná expresia IRF3-nirs3 potlačila transkripciu IFN- a uľahčila replikáciu vírusu [25]. Ďalšie IRF3 zostrihané izoformy sú identifikované s rôznym stupňom schopnosti inhibovať IRF3-sprostredkovanú aktiváciu transkripcie IFN- [26]. Nakoniec sa ukázalo, že heterogénny jadrový ribonukleoproteín A1 (hnRNPA1) a zostrihový faktor 1 bohatý na serín a arginín (SRSF1) podporujú zahrnutie exónu 2 a exónu 3 IRF3 a vytvárajú IRF3 s plnou dĺžkou, ktorý je potrebný pre IFN- aktivácia transkripcie [27]. Deplécia buď hnRNPA1 alebo SRSF1 spôsobuje zníženie aktivácie IFN-indukovanej poly (I:C). Nedávno sa ukázalo, že expresia IRF7 je regulovaná mechanizmom retencie intrónov prostredníctvom proteínu BUD13 [28]. BUD13 potláča retenciu intrónu 4 v transkripte IRF7. Výsledkom je, že sa vytvorí zrelý transkript IRF7 a proteín IRF7 sa preloží, aby podporil odpoveď IFN. Na podporu tohto pozorovania, knock-down BUD13 zvyšuje intrónovú retenciu transkriptu IRF7, ktorý sa zdá byť degradovaný nezmyslom sprostredkovaným rozpadom (NMD). V dôsledku toho je hladina proteínu IRF7 znížená, aby sa uľahčila replikácia vírusu [28]. Bolo publikovaných niekoľko ďalších variantov transkriptu IRF7 a niektoré môžu byť indukované infekciou respiračným syncyciálnym vírusom (RSV) [29,30]. Väčšina génov IFN typu I je bez intrónov, zatiaľ čo gény IFN typu III majú zvyčajne viacero intrónov, čo naznačuje potenciálny regulačný mechanizmus prostredníctvom AS. Nedávno objavený IFNL4, IFN typu III, je kódovaný génom obsahujúcim päť exónov a bolo pozorovaných niekoľko variantov transkriptu [31]. Funkčná charakterizácia ukazuje, že kompletné izoformy IFNL4, ale nie kratšie, vykazujú antivírusovú aktivitu [32]. Genetické varianty v exóne 1, ktoré negatívne korelujú s expresiou funkčného IFNL4, sú prekvapivo spojené s klírensom vírusu hepatitídy C (HCV) [31,33]. IFN proteíny typu I a III vykonávajú svoje funkcie (napr. spúšťajú produkciu antivírusových ISG) väzbou na ich príslušné receptory, ktoré sú exprimované ako rôzne izoformy. IFNAR1 a IFNAR2 tvoria receptorový komplex pre IFN typu I a IFNAR2 produkuje tri varianty mRNA AS, vrátane dvoch membránovo viazaných izoforiem (IFNAR2b a 2c) a rozpustnej izoformy (IFNAR2a) [34]. Transfekcia ľudského IFNAR1 a IFNAR2c, ale nie IFNAR2b, rekonštituovala antivírusovú odpoveď IFN [35]. To je v súlade s údajmi, že IFNAR2b môže pôsobiť ako dominantný, negatívny regulátor odpovedí IFN [36]. V ľudských bunkách boli opísané viaceré zostrihové varianty IFNLR1, s ktorými IL-10RB tvorí receptor IFN typu III [37–39]. IFNLR1 naviazaný na membránu je funkčná receptorová podjednotka, zatiaľ čo rozpustná zostrihnutá izoforma, ktorej chýba transmembránová doména kódujúca exón 6, slúži ako dominantná negatívna forma. Pridanie rekombinantného rozpustného IFNLR1 znížilo transkripciu ISG indukovanú IFN typu III v mononukleárnych bunkách periférnej krvi (PBMC) a v bunkách Huh7.5 [40]. Po naviazaní IFN typu I a III na ich receptory sa fosforylované STAT1 a STAT2 nakoniec translokujú do jadra, ktoré riadi expresiu ISG. STAT1 má dve izoformy [41], alfa a beta, ktoré sa líšia v C-terminálnej transaktivačnej doméne. Spočiatku sa STAT1 alfa považoval za jedinú funkčnú izoformu a STAT1 beta pravdepodobne pôsobí ako dominantný negatívny regulátor [42,43]. Nedávne štúdie však naznačujú, že STAT1 alfa a beta aktivujú prekrývajúci sa, ale nie redundantný súbor génov, ktoré sú dôležité pri regulácii imunity [44]. Okrem týchto dvoch izoforiem sa proteíny SM vírusu Epstein-Barrovej (EBV) spájajú s hostiteľským zostrihovým faktorom SRSF3 a podporujú použitie kryptického 50 zostrihového miesta, čím sa generuje variant transkriptu STAT1 alfa0 [45,46]. Úloha transkriptu STAT1 alfa0 a či je alebo nie je preložený, je zatiaľ nejasná. Vzhľadom na dôležitosť STAT1 a STAT2 pri riadení expresie ISG na vytvorenie antivírusového stavu sa aberantný zostrih týchto génov spája s poruchou imunity a závažným vírusovým ochorením [47–49]. Napríklad homozygotná mutácia vedúca k preskoku exónu 3 STAT1 vedie k jeho zníženej expresii a fosforylácii. Pacienti homozygotní pre túto mutáciu vykazujú výraznú náchylnosť na infekciu [49]. Mutácia v intróne 4 STAT2 spôsobuje aberantný zostrih a pravdepodobne vedie k NMD. Expresia proteínu STAT2 nie je detegovateľná v bunkách homozygotných pacientov a exogénna expresia STAT2 zachraňuje fenotyp a indukuje antivírusový stav [48]. Začínajú sa objavovať dôkazy, že funkcia ISG je regulovaná AS. OAS1 je kľúčovým komponentom antivírusového systému RNaseL 2-5A. Nedávna správa ukazuje, že gén Oas1g (myší homológ ľudského OAS1) má alternatívne 50 zostrihové miesto v intróne medzi exónom 3 a exónom 4 a použitie tohto alternatívneho 50 zostrihu vedie k nefunkčnému variantu mRNA, ktorý je určené na degradáciu [50]. Je zaujímavé, že odstránenie tohto alternatívneho miesta zostrihu zvyšuje expresiu Oas1g a inhibuje vírusovú infekciu. MxA je ďalší známy ISG, ktorý obmedzuje rôzne vírusy. Je zaujímavé, že vírusová infekcia HSV{179}} indukuje produkciu varMxA [51]. Tento transkript má odstránené exóny 14–16 a kóduje proteín, ktorý podporuje replikáciu HSV{183}}. Výskyt izoforiem vylučujúcich exón MxA bol tiež pozorovaný v bunkách infikovaných DENV [21]. Jeho regulačná funkcia pri replikácii DENV čaká na ďalšie skúmanie. Stručne povedané, rôzne izoformy kľúčových zložiek v odpovediach IFN typu I a typu III sú exprimované na reguláciu vrodenej imunity v reakcii hostiteľa (obrázok 1). Je zaujímavé, že väčšina AS udalostí downreguluje antivírusovú odpoveď, čo naznačuje, že posttranskripčná regulácia funguje na vyváženie transkripčnej upregulácie antivírusového stavu. To by znamenalo, že defekty v post-transkripčnej regulácii antivírusovej vrodenej imunitnej odpovede by viedli k autoimunite a patologickým zápalovým stavom.

cistanche benefits for men-strengthen immune system

cistanche výhody pre mužov-posilnenie imunitného systému

3. Ďalšie vrodené imunitné cesty ovplyvnené alternatívnym zostrihom RNA

Proteín promyelocytovej leukémie (PML), člen rodiny proteínov TRIM, je kľúčovou zložkou štruktúr známych ako jadrové telá PML, ktoré majú dôležitú úlohu vo vrodenej imunitnej signalizácii [52,53]. Gén PML pozostáva z deviatich exónov a podlieha rozsiahlej AS, ktorá generuje niekoľko variantov transkriptu [54]. Tieto izoformy zdieľajú aminoterminálne oblasti, ale líšia sa na C-konci. Dôležité je, že sa zdá, že majú rozdielne úlohy pri modulácii odpovede IFN. Uvádza sa, že izoforma PML IV zvyšuje aktivitu IRF3, čím sa podieľa na produkcii IFN- počas infekcie VSV [55]. V súlade s týmto zistením je nadmerná expresia izoformy PML IV dostatočná na potlačenie replikácie DENV [56]. Podobne PML izoforma II podporuje aktiváciu IFN- [57] a toto zlepšenie dosahuje spojením s rôznymi transkripčnými komplexmi. Deplécia izoformy II PML znížila nábor IRF3 a STAT1 do prvkov IFN-promótora a ISRE. Na rozdiel od PML izoformy II, knock-down PML izoformy V nemal vplyv na aktiváciu IFN-spustenú poly(I:C), čo naznačuje, že izoforma PML V nie je potrebná na reguláciu IFN odpovede [ 57]. Je zaujímavé, že infekcia vírusom herpes simplex typu 2 (HSV-2) spôsobila zmenu izoformy PML II na izoformu PML IV zvýšením využitia intrónu 7a prostredníctvom vírusových proteínov ICP27 [58]. To je v súlade s vírusovou stratégiou na antagonizáciu odpovede hostiteľského IFN na replikáciu vírusu, pretože izoforma II, ako aj izoforma IV, podporuje aktiváciu IFN-. Obnova PML izoformy II v PML-zničených bunkách však uľahčuje replikáciu HSV2. Deplécia izoformy II PML prostredníctvom siRNA znížila infekčnosť HSV2, čo naznačuje, že izoforma II PML je pro-HSV2 faktorom. Tieto výsledky naznačujú komplexnú a možno paradoxnú úlohu PML v interakciách hostiteľ-vírus. Proteín zinkového prsta (ZFR) sa podieľa na niekoľkých bunkových funkciách a je silným modulátorom zostrihu. ZFR kontroluje IFN signalizáciu tým, že bráni aberantnému zostrihu a nezmyslom sprostredkovanému rozpadu histónových variantov makroH2A1 mRNA [59]. V bunkách exprimujúcich ZFR ZFR podporuje použitie exónu 6a makroH2A1, čo vedie k produkcii makroH2A1 s plnou dĺžkou, ktorý potláča promótor IFN- a zabraňuje aktivácii transkripcie. V bunkách ochudobnených o ZFR vedie vzájomne sa vylučujúce použitie exónu 6b k zostrihnutému transkriptu určenému pre NMD. V dôsledku toho sa IFN-promótor uvoľní z represie a môže byť prístupný transkripčným faktorom pre génovú expresiu. Konzistentne buď knock-down ZFR alebo makroH2A1 zosilňujú transkripciu IFN-. Okrem toho deplécia ZFR obmedzuje replikáciu vírusu [59]. hnRNP M patrí do rodiny všadeprítomne exprimovaných heterogénnych jadrových ribonukleoproteínov (hnRNP) a ovplyvňuje spracovanie pre-mRNA a niekoľko ďalších aspektov metabolizmu a transportu mRNA. Nedávno sa ukázalo, že hnRNP M má schopnosť potláčať imunitu prostredníctvom odlišných mechanizmov. Po prvé, tento proteín interaguje s RIG-I a zhoršuje imunitné snímanie [60]. Okrem toho hnRNP M podporuje zadržiavanie intrónov na zníženie množstva transkriptov IL{51}}. Celkovo v dôsledku vyčerpania hnRNP M tlmí imunitu hostiteľa a uľahčuje replikáciu vírusu [61].

4. Alternatívny zostrih reguluje cesty smrti hostiteľských buniek aktivované počas vírusovej infekcie

Bolo popísaných niekoľko programov bunkovej smrti a molekulárne mechanizmy týchto programov sa prekrývajú, ale dosť sa líšia [62]. Tu diskutujeme o AS regulácii apoptózy, nekroptózy a pyroptózy v kontexte interakcií hostiteľ-vírus (obrázok 2). Vírusy vo veľkej miere interagujú s bunkovými vnútornými a vonkajšími apoptotickými dráhami [63,64] a zostrihané izoformy apoptotických faktorov môžu hrať kľúčovú úlohu pri určovaní bunkového osudu [65,66]. Apoptóza je vo všeobecnosti chápaná ako nezápalový typ programovanej bunkovej smrti, charakterizovaný morfologickými zmenami, vrátane bunkového zmršťovania, jadrovej kondenzácie a krvácania z plazmatickej membrány. Vnútorná apoptóza je primárne riadená v mitochondriách. Narušenie vnútrobunkovej homeostázy (napr. poškodenie DNA alebo oxidačný stres) a proapoptotické stimuly vedú k indukcii permeabilizácie vonkajšej membrány mitochondrií (MOMP) proteínmi BAX alebo BAK. V neprítomnosti apoptotických stimulov sú tieto proteíny sekvestrované v neaktívnom stave antiapoptickými členmi rodiny proteínov BCL2. MOMP uvoľňuje cytochróm c do cytoplazmy a spúšťa tvorbu apoptozómového proteínového komplexu obsahujúceho apoptotický proteázový aktivačný faktor 1 (APAF1) a kaspázu 9, člen bunkových cysteín-asparágových proteáz. Aktivovaná kaspáza 9 potom štiepi kaspázy 3 a 7, čo spúšťa dráhu vedúcu k bunkovej smrti. Je zaujímavé, že vírusová infekcia aktivuje netranskripčné interakcie IRF3–Bax a spôsobuje MOMP a bunkovú smrť [67,68]. Vírusová infekcia môže tiež spustiť vonkajšiu apoptózu [63]. Vonkajšia dráha je primárne iniciovaná väzbou ligandov na rôzne receptory smrti, aktiváciou kaspázy 8 a vedúcou k aktivácii kaspázy 3 a apoptóze.

Figure 2. Alternative splicing regulates host cell death pathways activated during viral infection.

Obrázok 2. Alternatívny zostrih reguluje cesty smrti hostiteľských buniek aktivované počas vírusovej infekcie.

Nekroptóza je zápalový typ bunkovej smrti charakterizovaný opuchom buniek, stratou permeability plazmatickej membrány a uvoľnením cytosolického obsahu do extracelulárneho priestoru [77]. Niektoré vírusové infekcie spúšťajú nekroptózu prostredníctvom membránovo viazaných receptorov (napr. TLR3 [78,79]) alebo cytosolických senzorov (napr. ZBP1 [80–82]) a kulminujú aktiváciou a fosforyláciou proteínu podobného kinázovej doméne zmiešanej línie (MLKL ), ktorý tvorí homotrimérny komplex, ktorý sa premiestňuje do plazmatickej membrány, kde vytvára pór a vyvoláva lýzu buniek [83,84]. MLKL má dve izoformy, MLKL1 a MLKL2 [85]; MLKL2 je silnejším induktorom nekroptózy ako MLKL1 [86]. Toto zvýšenie aktivity možno pripísať zmenenej doménovej štruktúre MLKL2. MLKL2 nemá exóny 4-8, a preto MLKL2 nemá väčšinu C-terminálnej pseudokinázovej domény, o ktorej sa predpokladá, že slúži ako supresívna funkcia. Ďalšie kľúčové zložky v dráhe nekroptózy zahŕňajú receptor-interagujúcu serín/treonín-proteínkinázu 1 (RIPK1) a receptor-interagujúcu serín/treonín-proteínkinázu 3 (RIPK3), pričom sa uvádza, že oba gény kódujú transkripčné varianty. Skríning celého genómu CRISPR identifikoval PTBP1 ako nový regulátor zostrihu RIPK1 pri nekroptóze [87]. PTBP1 potláča alternatívnu inklúziu exónu medzi kanonické exóny 4 a 5 a podporuje expresiu proteínu RIPK1 v plnej dĺžke na vyvolanie bunkovej smrti. V súlade s PTBP1-sprostredkovaným preskočením exónu bol identifikovaný charakteristický trakt bohatý na CU v intróne susediacom s 30 zostrihovým miestom [87]. Nakoniec, RIPK3 má dva zostrihové varianty, RIPK3 beta a RIPK3 gama, z ktorých sa zdá, že oba potláčajú bunkovú smrť [88]. Pyroptóza, ktorá je tiež zápalovou formou bunkovej smrti, je indukovaná aktiváciou zápalu a je rozhodujúca pre antivírusovú odpoveď [89,90]. Táto cesta smrti je iniciovaná detekciou PAMP alebo molekulárnych vzorov spojených s nebezpečenstvom (DAMPs) inflammasómovými proteínmi, z ktorých väčšina sú členmi rodiny Nod-like receptorov (NLR) [91]. Následne nábor proteínu podobného škvrnitosti spojeného s adaptorovou apoptózou, ktorý obsahuje CARD (ASC) a kaspázu 1, tvorí zápalový proteínový komplex. Aktivovaná kaspáza 1 by štiepila plynový dermín D (GSDMD), čím by sa uvoľnila doména GSDMD-N. Doména GSDMD-N sa premiestňuje do plazmatickej membrány a oligomerizuje sa, čím vznikajú membránové póry. Táto tvorba pórov narúša osmotický potenciál, čo vedie k opuchu buniek a prípadnej lýze. Okrem toho aktívna kaspáza{56}} spracováva pro-IL{58}} a pro-IL-18 na bioaktívne formy, ktoré podporujú zápal. Spomedzi mnohých NLR je doména pyrínu rodiny NLR obsahujúca 3 (NLRP3) dôležitá v antivírusovej odpovedi [89] a nedávno sa ukázalo, že je regulovaná na úrovni zostrihu. Nový zostrihaný variant NLRP3, ktorému chýba exón 5, kóduje časť domény LRR [92]. Delécia tejto oblasti ruší jej interakciu s proteínom kinázy 7 (NEK7) súvisiacej s NIMA, ktorého väzba je predpokladom aktivácie NLRP3, a tým robí NLRP3 ∆exón5 neaktívnym. Ďalšou kritickou zložkou v zápale je adaptor ASC, zložený z N-koncovej PYD domény na asociáciu s NLR proteínmi, spojovacej oblasti a C-koncovej CARD domény na interakciu s kaspázovými proteínmi. Zostrihnutému variantu ASC-b chýba exón 2, kódujúci linker, a je schopný aktivovať zápal NLRP3 [93]. V súlade s tým pacient s touto deléciou exónu 2 ASC vykazuje vyššiu hladinu IL-1 proteínu v sére [94]. Ďalšia zostrihnutá izoforma ASC-c má deléciu v PYD doméne. Pôsobí ako dominantný negatívny regulátor a znižuje aktiváciu NLRP3 [93].

Desert ginseng—Improve immunity (20)

výhody doplnku cistanche-zvýšenie imunity

Kliknite sem pre zobrazenie produktov Cistanche Enhance Immunity

【Požiadať o viac】 E-mail:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

5. Závery

Vírusová infekcia spúšťa v hostiteľovi nespočetné množstvo bunkových udalostí. Väčšina skorších štúdií sa zamerala na úlohu transkripcie pri vytváraní bunkovej antivírusovej odpovede. V tomto prehľade diskutujeme o nedostatočne preskúmanej úlohe AS pri regulácii reakcie hostiteľa počas vírusovej infekcie. Zdá sa, že väčšina doteraz objavených regulačných udalostí AS negatívne moduluje antivírusovú odpoveď. To by znamenalo, že defekty v post-transkripčnej regulácii antivírusovej vrodenej imunitnej odpovede by viedli k autoimunite a patologickým zápalovým stavom. S príchodom sekvenovania novej generácie boli urobené nové objavy na vymedzenie toho, ako je modulovaný mechanizmus zostrihu hostiteľa počas vírusovej infekcie [95,96]. Je zrejmé, že AS hrá rozhodujúcu úlohu pri regulácii produktívnej vrodenej imunitnej odpovede; avšak funkčný význam mnohých nových izoforiem AS a regulačné mechanizmy, ktorými sú tieto zostrihané varianty generované, zostávajú neúplne pochopené. Ďalšie skúmanie by malo preskúmať AS ako dôležitú vrstvu regulácie interakcií vírus-hostiteľ a potenciálne identifikovať nové ciele pre terapeutický vývoj na liečbu infekčných chorôb.

Referencie

1. Wilkinson, ME; Charenton, C.; Nagai, K. Zostrih RNA pomocou spliceozómu. Annu. Biochem. 2020, 89, 359–388. [CrossRef] [PubMed]

2. Wang, ET; Sandberg, R.; Luo, S.; Khrebtuková, I.; Zhang, L.; Mayr, C.; Kingsmore, SF; Schroth, praktický lekár; Burge, CB Alternatívna regulácia izoforiem v transkriptómoch ľudského tkaniva. Príroda 2008, 456, 470–476. [CrossRef] [PubMed]

3. Fu, XD; Ares, M., Jr. Kontextovo závislá kontrola alternatívneho zostrihu pomocou proteínov viažucich RNA. Nat. Genet. 2014, 15, 689–701. [CrossRef] [PubMed]

4. Evsyukova, I.; Somarelli, JA; Gregory, SG; Garcia-Blanco, MA Alternatívny zostrih pri skleróze multiplex a iných autoimunitných ochoreniach. RNA Biol. 2010, 7, 462–473. [CrossRef]

5. Tazi, J.; Bakkour, N.; Stamm, S. Alternatívne spájanie a choroba. Biochim. Biophys. Acta 2009, 1792, 14–26. [CrossRef]

6. Hopfner, KP; Hornung, V. Molekulárne mechanizmy a bunkové funkcie cGAS-STING signalizácie. Nat. Mol. Cell Biol. 2020, 21, 501–521. [CrossRef]

7. Sun, B.; Sundstrom, KB; Chew, JJ; Bist, P.; Gan, ES; tan, HC; Goh, KC; Chawla, T.; Tang, CK; Ooi, EE vírus dengue aktivuje cGAS uvoľnením mitochondriálnej DNA. Sci. Rep. 2017, 7, 3594. [CrossRef]

8. Lazear, HM; Schoggins, JW; Diamantové, MS zdieľané a odlišné funkcie interferónov typu I a typu III. Imunita 2019, 50, 907–923. [CrossRef]

9. Gack, MU; Kirchhofer, A.; Shin, YC; Inn, KS; Liang, C.; Cui, S.; Myong, S.; Ha, T.; Hopfner, KP; Jung, JU Úlohy RIG-I N-terminálnej tandemovej CARD a zostrihového variantu v TRIM25-sprostredkovanej transdukcii antivírusového signálu. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 2008, 105, 16743–16748. [CrossRef]

10. Seo, JW; Yang, EJ; Kim, SH; Choi, IH Inhibičná alternatívna zostrihová izoforma Toll-like receptora 3 je indukovaná interferónmi typu I v ľudských astrocytových bunkových líniách. BMB Rep. 2015, 48, 696–701. [CrossRef]

11. Yang, E.; Shin, JS; Kim, H.; Park, HW; Kim, MH; Kim, SJ; Choi, IH Klonovanie izoformy TLR3. Yonsei Med. J. 2004, 45, 359-361. [CrossRef] [PubMed]

12. Lad, SP; Yang, G.; Scott, DA; Chao, TH; Correia Jda, S.; de la Torre, JC; Li, E. Identifikácia variantov zostrihu MAVS, ktoré interferujú so signalizáciou dráhy RIGI/MAVS. Mol. Immunol. 2008, 45, 2277–2287. [CrossRef] [PubMed]

13. Chen, H.; Pei, R.; Zhu, W.; Zeng, R.; Wang, Y.; Wang, Y.; Lu, M.; Chen, X. Alternatívna zostrihová izoforma MITA antagonizuje MITA-sprostredkovanú indukciu IFN typu I. J. Immunol. 2014, 192, 1162–1170. [CrossRef]

14. Han, KJ; Yang, Y.; Xu, LG; Shu, HB Analýza TIR-bez zostrihového variantu TRIF odhaľuje neočakávaný mechanizmus TLR3-sprostredkovanej signalizácie. J. Biol. Chem. 2010, 285, 12543–12550. [CrossRef] [PubMed]

15. Oshiumi, H.; Matsumoto, M.; Funami, K.; Akazawa, T.; Seya, T. TICAM-1, molekula adaptéra, ktorá sa podieľa na indukcii interferónu-beta sprostredkovanej 3-receptorom podobným Toll. Nat. Immunol. 2003, 4, 161–167. [CrossRef]

16. Michel, M.; Wilhelmi, I.; Schultz, AS; Preussner, M.; Heyd, F. Alternatívny zostrih faktora 3 spojeného s receptorom faktora nekrózy nádorov vyvolaný aktiváciou (Traf3) riadi dráhu nekanonického jadrového faktora kappa B a expresiu chemokínov v ľudských T bunkách. J. Biol. Chem. 2014, 289, 13651–13660. [CrossRef]

17. Schultz, AS; Preussner, M.; Bunse, M.; Karni, R.; Heyd, F. Alternatívny zostrih TRAF3 exónu 8 závislý od aktivácie je riadený väzbou CELF2 a hnRNP C na upstream intronický prvok. Mol. Cell Biol. 2017, 37, e00488-16. [CrossRef]

18. Deng, W.; Shi, M.; Han, M.; Zhong, J.; Li, Z.; Li, W.; Hu, Y.; Yan, L.; Wang, J.; On, Y.; a kol. Negatívna regulácia vírusom spustenej signálnej dráhy IFN-beta alternatívnym zostrihom TBK1. J. Biol. Chem. 2008, 283, 35590–35597. [CrossRef]

19. Fabozzi, G.; Oler, AJ; Liu, P.; Chen, Y.; Mindaye, S.; Dolan, MA; Kenney, H.; Gucek, M.; Zhu, J.; Rabin, RL; a kol. Sekvenovanie duálnej RNA špecifické pre vlákno bronchiálnych epiteliálnych buniek infikovaných vírusmi chrípky A/H3N2 odhaľuje zostrih génového segmentu 6 a nové interakcie hostiteľ-vírus. J. Virol. 2018, 92, e00518-18. [CrossRef]

20. Koop, A.; Lepenies, I.; Braum, O.; Davarnia, P.; Scherer, G.; Fickenscher, H.; Kabelitz, D.; Adam-Klages, S. Nové zostrihové varianty ľudského IKKepsilon negatívne regulujú aktiváciu IRF3 a NF-kB indukovanú IKKepsilon. Eur. J. Immunol. 2011, 41, 224–234. [CrossRef]

21. De Maio, FA; Risso, G.; Iglesias, NG; Shah, P.; Pozzi, B.; Gebhard, LG; Mammi, P.; Mancini, E.; Yanovsky, MJ; Andino, R.; a kol. Proteín NS5 vírusu dengue preniká do bunkového spliceozómu a moduluje zostrih. PLoS Pathog. 2016, 12, e1005841. [CrossRef] [PubMed]

22. Karpová, AY; Ronco, LV; Howley, PM Funkčná charakterizácia interferónového regulačného faktora 3a (IRF-3a), alternatívnej zostrihovej izoformy IRF-3. Mol. Cell Biol. 2001, 21, 4169-4176. [CrossRef]

23. Karpová, AY; Howley, PM; Ronco, LV Dvojité využitie akceptorového/donorového zostrihového miesta riadi alternatívny zostrih génu IRF-3. Genes Dev. 2000, 14, 2813–2818. [CrossRef]

24. Li, C.; Ma, L.; Chen, X. Interferónový regulačný faktor 3-CL, izoforma IRF3, antagonizuje aktivitu IRF3. Cell Mol. Immunol. 2011, 8, 67–74. [CrossRef] [PubMed]

25. Marozin, S.; Altomonte, J.; Stadler, F.; Thasler, MY; Schmid, RM; Ebert, O. Inhibícia odpovede IFN-beta pri hepatocelulárnom karcinóme alternatívne zostrihnutou izoformou regulačného faktora IFN-3. Mol. Ther. 2008, 16, 1789–1797. [CrossRef] [PubMed]

26. Li, Y.; Hu, X.; Song, Y.; Lu, Z.; Ning, T.; Cai, H.; Ke, Y. Identifikácia nových alternatívnych zostrihových variantov regulačného faktora interferónu 3. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1809, 166–175. [CrossRef] [PubMed]

27. Guo, R.; Li, Y.; Ning, J.; Sun, D.; Lin, L.; Liu, X. HnRNP A1/A2 a SF2/ASF regulujú alternatívny zostrih interferónového regulačného faktora-3 a ovplyvňujú imunomodulačné funkcie v ľudských bunkách nemalobunkového karcinómu pľúc. PLoS ONE 2013, 8, e62729. [CrossRef]

28. Frankiw, L.; Majumdar, D.; Burns, C.; Vlach, L.; Moradian, A.; Sweredoski, MJ; Baltimore, D. BUD13 podporuje odozvu interferónu typu I proti zadržiavaniu intrónov v Irf7. Mol. Cela 2019, 73, 803–814. [CrossRef]

29. Xu, X.; Mann, M.; Qiao, D.; Brasier, AR Alternatívne spracovanie mRNA dráh vrodenej odozvy pri infekcii respiračným syncyciálnym vírusom (RSV). Vírusy 2021, 13, 218. [CrossRef]

30. Zhang, L.; Pagano, JS Štruktúra a funkcia IRF-7. J. Interferon Cytokine Res. 2002, 22, 95-101. [CrossRef]

31. Prokunina-Olsson, L.; Muchmore, B.; Tang, W.; Pfeiffer, RM; Park, H.; Dickensheets, H.; Hergott, D.; Porter-Gill, P.; Mumy, A.; Kohaar, I.; a kol. Variant upstream od IFNL3 (IL28B), ktorý vytvára nový interferónový gén IFNL4, je spojený so zhoršeným klírensom vírusu hepatitídy C. Nat. Genet. 2013, 45, 164–171. [CrossRef]

32. Hong, M.; Schwerk, J.; Lim, C.; Kell, A.; Jarret, A.; Pangallo, J.; Loo, YM; Liu, S.; Hagedorn, CH; Gale, M., Jr.; a kol. Expresia interferónu lambda 4 je potlačená hostiteľom počas vírusovej infekcie. J. Exp. Med. 2016, 213, 2539–2552. [CrossRef]

33. Tesák, MZ; Jackson, SS; O'Brien, TR IFNL4: Pozoruhodné varianty a súvisiace fenotypy. Gene 2020, 730, 144289. [CrossRef] [PubMed]

34. Lutfalla, G.; Holandsko, SJ; Cinato, E.; Monneron, D.; Reboul, J.; Rogers, NC; Smith, JM; Stark, GR; Gardiner, K.; Mogensen, KE; a kol. Mutantné bunky U5A sú doplnené podjednotkou receptora interferónu-alfa beta vytvorenou alternatívnym spracovaním nového člena génového klastra cytokínového receptora. EMBO J. 1995, 14, 5100-5108. [CrossRef]

35. Cohen, B.; Novick, D.; Barák, S.; Rubinstein, M. Ligandom indukovaná asociácia komponentov interferónového receptora typu I. Mol. Cell Biol. 1995, 15, 4208-4214. [CrossRef] [PubMed]

36. Gazziola, C.; Cordani, N.; Carta, S.; De Lorenzo, E.; Colombatti, A.; Perris, R. Relatívne hladiny endogénnej expresie izoforiem IFNAR2 ovplyvňujú cytostatický a proapoptotický účinok IFNalfa na bunky pleomorfného sarkómu. Int. J. Oncol. 2005, 26, 129–140.

37. Sheppard, P.; Kindsvogel, W.; Xu, W.; Henderson, K.; Schlutsmeyer, S.; Whitmore, TE; Kuestner, R.; Garrigues, U.; Birks, C.; Roraback, J.; a kol. IL-28, IL-29 a ich cytokínový receptor triedy II IL-28R. Nat. Immunol. 2003, 4, 63–68. [CrossRef] [PubMed]

38. Dumoutier, L.; Lejeune, D.; Hor, S.; Fickenscher, H.; Renauld, JC. Klonovanie nového prevodníka signálu aktivujúceho cytokínový receptor typu II a aktivátora transkripcie (STAT)1, STAT2 a STAT3. Biochem. J. 2003, 370, 391-396. [CrossRef] [PubMed]

39. Witte, K.; Gruetz, G.; Volk, HD; Looman, AC; Asadullah, K.; Sterry, W.; Šabat, R.; Wolk, K. Napriek expresii receptora IFN-lambda majú krvné imunitné bunky, ale nie keratinocyty alebo melanocyty, zhoršenú odpoveď na interferóny typu III: Dôsledky pre terapeutické aplikácie týchto cytokínov. Genes Immun. 2009, 10, 702-714. [CrossRef]

40. Santer, DM; Minty, GES; Golec, DP; Lu, J.; May, J.; Namdar, A.; Shah, J.; Elahi, S.; Hrdý, D.; Joyce, M.; a kol. Diferenciálna expresia zostrihových variantov interferónu-lambda receptora 1 určuje veľkosť antivírusovej odpovede indukovanej interferónom-lambda 3 v ľudských imunitných bunkách. PLoS Pathog. 2020, 16, e1008515. [CrossRef]

41. Schindler, C.; Fu, XY; Improta, T.; Aebersold, R.; Darnell, JE, Jr. Proteíny transkripčného faktora ISGF-3: Jeden gén kóduje proteíny 91-a 84-kDa ISGF-3, ktoré sú aktivované interferónom alfa. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 1992, 89, 7836–7839. [CrossRef] [PubMed]

42. Baran-Marszak, F.; Feuillard, J.; Najjar, I.; Le Clorennec, C.; Bechet, JM; Dusanter-Fourt, I.; Bornkamm, GW; Raphael, M.; Fagard, R. Diferenciálne úlohy STAT1alfa a STAT1beta pri zastavení bunkového cyklu a apoptóze indukovanej fludarabínom v ľudských B bunkách. Krv 2004, 104, 2475–2483. [CrossRef] [PubMed]

43. Walter, MJ; Pozri, DC; Tidwell, RM; Roswit, WT; Holtzman, MJ Cielená inhibícia expresie intercelulárnej adhéznej molekuly-1 (ICAM-1) závislej od interferónu-gama pomocou dominantne negatívneho Stat1. J. Biol. Chem. 1997, 272, 28582–28589. [CrossRef]

44. Semper, C.; Leitner, NR; Lassnig, C.; Parrini, M.; Mahlakoiv, T.; Rammerstorfer, M.; Lorenz, K.; Rigler, D.; Muller, S.; Kolbe, T.; a kol. STAT1beta nie je dominantným negatívom a je schopný prispievať k prirodzenej imunite závislej od gama interferónu. Mol. Cell Biol. 2014, 34, 2235–2248. [CrossRef] [PubMed]

45. Verma, D.; Swaminathan, S. SM proteín vírusu Epstein-Barr funguje ako alternatívny zostrihový faktor. J. Virol. 2008, 82, 7180-7188. [CrossRef] [PubMed]

46. ​​Verma, D.; Bais, S.; Gaillard, M.; Swaminathan, S. SM proteín vírusu Epstein-Barr využíva bunkový zostrihový faktor SRp20 na sprostredkovanie alternatívneho zostrihu. J. Virol. 2010, 84, 11781–11789. [CrossRef]

47. Du, Z.; Fan, M.; Kim, JG; Eckerle, D.; Lothstein, L.; Wei, L.; Pfeffer, LM Bunková línia Daudi rezistentná na interferón s defektom Stat2 je odolná voči apoptóze indukovanej chemoterapeutikami. J. Biol. Chem. 2009, 284, 27808–27815. [CrossRef]

48. Hambleton, S.; Goodbourn, S.; Young, DF; Dickinson, P.; Mohamad, SM; Valappil, M.; McGovern, N.; Cant, AJ; Hackett, SJ; Ghazal, P.; a kol. Nedostatok STAT2 a náchylnosť na vírusové ochorenia u ľudí. Proc. Natl. Akad. Sci. USA 2013, 110, 3053–3058. [CrossRef]

49. Vairo, D.; Tassone, L.; Tabellini, G.; Tamassia, N.; Gasperini, S.; Bazzoni, F.; Plebani, A.; Porta, F.; Notarangelo, LD; Parolini, S.; a kol. Závažné poškodenie reakcií IFN-gama a IFN-alfa v bunkách pacienta s novou zostrihovou mutáciou STAT1. Krv 2011, 118, 1806–1817. [CrossRef]


Tiež sa vám môže páčiť