SARS-CoV-2 Infekcia a účinnosť vakcíny v Anglicku (REACT-1): Séria prierezových náhodných komunitných prieskumov

Kontakt: Audrey Hu Whatsapp/hp: 0086 13880143964 E-mail:audrey.hu@wecistanche.com

Marc Chateau-Hyam, Haowei Wang*, Oliver Eales*, David Haw*, Barbara Bodinier*, Matthew Whitaker, Caroline E Walters, Kylie EC Ainslie, Christina Atchison, Claudio Fronterre, Peter J Diggle, Andrew J Page, Alexander J Trotter, Deborah Ashby, Wendy Barclay, Graham Taylor, Graham Cooke, Helen Ward, Ara Darzi, Steven Riley, Christl A Donnelly†, Paul Elliott†, v spolupráci s konzorciom COVID{1}} Genomics UK

Zhrnutie

Pozadie: Anglicko zažilo tretiu vlnu epidémie COVID{{0}}} od konca mája 2{{40}}21, ktorá sa časovo zhodovala s rýchlym šírením delty (B. 1.617.2), napriek vysokej úrovni zaočkovanosti medzi dospelými. Miera zaočkovanosti (jednorazová dávka) v Anglicku je nižšia u detí vo veku 16 – 17 rokov a 12 – 15 rokov, ktorých očkovanie v Anglicku sa začalo v auguste a 2. septembra 2121. Zamerali sme sa na analýzu základných vzorcov dynamiky v prevalencii SARS-CoV-2 počas 2. septembra021 v Anglicku. Metódy: Štúdia Real-time Assessment of Community Transmission-1 (REACT{15}}), ktorá začala zhromažďovať údaje 2. mája02{{10{{128} }}}, zahŕňa sériu náhodných prierezových prieskumov vo všeobecnej populácii Anglicka vo veku 5 rokov a viac. Pomocou údajov o pozitivite výterov RT-PCR od {{2{131}}}} účastníkov s platnými výtermi z hrdla a nosa v 14. kole REACT-1 (9. – 27. septembra, 2.021), odhadli sme komunitnú prevalenciu SARS-CoV-2 a účinnosť vakcíny proti infekcii kombináciou údajov zo 14. kola s údajmi z 13. kola (24. júna až 12. júla021; n{{34} }). Zistenia: Počas 2. septembra021 sme odhadli priemernú mieru pozitivity RT-PCR na 0·83 percent (95 percent CrI 0,76–0,89), s reprodukčným číslom (R) celkovo 1,03 (95 percent CrI 0,94–1,14). Spomedzi 475 (62,2 percenta) zo 764 sekvenovaných pozitívnych výterov boli všetky delta variantu; 22 (4,63 percent; 95 percent CI 3,07–6,91) zahŕňalo mutáciu Tyr145His v spike proteíne spojenom s podlíniou AY.4 a bola tu jedna mutácia Glu484Lys. Vek, región, postavenie kľúčového pracovníka a veľkosť domácnosti spoločne prispeli k riziku pozitivity výteru. Najvyššia vážená prevalencia bola pozorovaná medzi deťmi vo veku 5–12 rokov, 2,32 percent (95 percent CrI 1,96–2,73) a deťmi vo veku 13–17 rokov, na úrovni 2,55 percent (2,11–3 ·08). Epidémia SARS-CoV-2 vzrástla u osôb vo veku 5–11 rokov s R 1,42 (95 percent CrI 1,18–1,68), ale klesla u osôb vo veku 18–54 rokov, pričom R 0,81 (0,68–0,97). Vo veku 18 až 64 rokov bola upravená účinnosť vakcíny proti infekcii 62,8 percenta (95 percent CI 49,3 až 72,7) po dvoch dávkach v porovnaní s neočkovanými ľuďmi, pre všetky vakcíny dohromady 44,8 percent (22 ·5–60,7) pre vakcínu ChAdOx1 n Cov{118}} (Oxford–AstraZeneca) a 71,3 percenta (56,6–81,0) pre vakcínu BNT162b2 (Pfizer–BioNTech). U jedincov vo veku 18 rokov a starších bola vážená prevalencia pozitivity výteru 0,35 percenta (95 percent CrI 0,31–0,40), ak bola druhá dávka podaná až 3 mesiace pred ich výterom, ale 0,55 percenta ( 0,50–0,61) u tých, ktorí dostali druhú dávku 3–6 mesiacov pred výterom, v porovnaní s 1,76 percentami (1,60–1,95) medzi neočkovanými jedincami.Výklad:V septembri 2021, na začiatku jesenného školského roka v Anglicku, počet infekcií u detí vo veku 5 – 17 rokov exponenciálne narastal, v čase, keď bola miera zaočkovanosti v tejto vekovej skupine nízka. U dospelých v porovnaní s tými, ktorí dostali druhú dávku pred menej ako 3 mesiacmi, vyššia prevalencia pozitivity výteru 3–6 mesiacov po dvoch dávkach vakcíny COVID-19 naznačuje zvýšené riziko prelomových infekcií počas tohto obdobia . Očkovací program sa musí dostať k deťom, ako aj k neočkovaným a čiastočne zaočkovaným dospelým, aby sa znížil prenos SARS-CoV-2 a súvisiace prerušenia práce a vzdelávania. Financovanie Ministerstvo zdravotníctva a sociálnej starostlivosti, Anglicko.

cistanche zdravotné prínosy: zlepšenie imunity

Úvod

Spojené kráľovstvo zaznamenalo od začiatku pandémie jednu z najvyšších mier infekcií SARS-CoV-2 a úmrtnosti na COVID-19 v Európe. Spojené kráľovstvo však bolo tiež jednou z prvých krajín, ktoré zaviedli národný očkovací program, ktorý sa začal v decembri 2020 a ktorý sa pôvodne zameral na populáciu, ktorá bola pôvodne zameraná na tých, ktorí sú najviac ohrození, vrátane starších ľudí (začínajúc osobami vo veku nad 80 rokov rokov), zdravotnícki a sociálni pracovníci a osoby so stanoveným zdravotným stavom.1

Rýchle rozšírenie delta (B.1.617.2) variantu v Anglicku od mája 2021 sa zhodovalo s treťou vlnou infekcií2 a prevalencia infekcií zostala vysoká až do leta a neskôr. Počas augusta 2021 sa incidencia RT-PCR potvrdených prípadov infekcie SARS-CoV-2 prezentovaných v národnom testovacom programe v Anglicku (pilier 2) postupne zvýšila celkovo o viac ako 10 percent.

V septembri 2021 bolo zavedenie národného programu očkovania proti COVID-19 v Anglicku rozšírené tak, aby poskytovalo posilňovaciu (tretiu) dávku, najmenej 6 mesiacov po druhej dávke, zdravotníckym a sociálnym pracovníkom, všetkým starším osobám nad 50 rokov a ohrození mladší ľudia. Toto rozšírenie zahŕňalo aj očkovanie detí staršieho školského veku (vo veku 12 alebo viac rokov), ktorým bola pôvodne ponúkaná jedna dávka vakcíny v celom Spojenom kráľovstve. Do polovice septembra 2021 však počet ľudí, ktorí dostali prvé očkovacie dávky, klesol na najnižšiu úroveň (v priemere tesne pod 21 000 dávok denne v Spojenom kráľovstve) minimálne od polovice januára 2021 (najskoršie verejne dostupné údaje) . Napriek tomu k 26. septembru 2021 takmer 90 percent jednotlivcov vo veku 18 rokov a starších v Anglicku dostalo svoju prvú dávku, viac ako 83 percent dostalo druhú dávku a 13 percent dostalo tretiu dávku vakcíny. Medzi deťmi vo veku 12 – 17 rokov dostalo jednu dávku 8,9 percenta. Približne 53 percent dospelých bolo očkovaných vakcínou ChAdOx1 nCov-19 (Oxford–AstraZeneca) a 47 percent vakcínou BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) alebo vakcínou mRNA-1273 (Moderna);3 všetky očkované deti vo veku 12–17 rokov dostali jednu dávku vakcíny BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) alebo mRNA-1273 (Moderna).

Začiatkom septembra 2021 sa deti vo veku 5 – 17 rokov v Anglicku vrátili do školy, pričom ministerstvo školstva už neodporúčalo, že je potrebné udržiavať deti v nekonzistentných skupinách (označovaných ako sociálne bubliny). Okrem toho sa od škôl už neočakávalo, že budú vyhľadávať kontakty, pričom úzke kontakty v školách teraz identifikoval národný program sledovania kontaktov (služba testovania a sledovania Národnej zdravotnej služby Spojeného kráľovstva [NHS]).4 Počas tohto prvého mesiaca po návrate detí do školy , výskyt potvrdených prípadov SARS-CoV-2 v Anglicku zaznamenaných prostredníctvom 2. piliera klesol v polovici septembra 2021 na minimum a potom opäť vzrástol, ale celkovo bol relatívne stabilný. To je v ostrom kontraste so situáciou v Škótsku, kde sa výskyt potvrdených prípadov SARS-CoV{10}} zvýšil o viac ako 450 percent počas augusta, v čase, keď deti školského veku (vo veku 5 – 17 rokov) v Škótsko sa vrátilo do školy.5 Takéto trendy na národnej úrovni (a viac na miestnej úrovni) vo veľkej miere závisia od kontextu vrátane miestnej prevalencie a dynamiky prenosu delta variantu, návratu do školy, zmien vo vzorcoch sociálneho miešania, práce doma verzus kancelárska práca. a úrovne očkovaním vyvolanej a prirodzene získanej imunity.

V tomto dokumente popisujeme základné vzorce dynamiky prevalencie SARS-CoV-2 počas septembra 2021 v Anglicku analýzou pozitivity výteru RT-PCR zo štrnásteho kola zberu údajov hodnotenia prenosu v reálnom čase v reálnom čase{{ 5}} (REACT-1) štúdia.6,7 V tomto kole sa výtery z hrdla a nosa získali od náhodnej vzorky populácie Anglicka od 9. septembra do 27. septembra 2021. Skombinovali sme aj údaje zo 14. kola s údajmi z 13. kola, v ktorom sa robili výtery od 24. júna do 12. júla 2021.

prášok z cistanche extraktu

Metódy

Študijná populácia

Metódy štúdie REACT{0}} boli opísané inde.7 Stručne: so zberom údajov od 1. mája 2020 sme do štúdie pozvali náhodné prierezové vzorky populácie v Anglicku (vo veku 5 rokov alebo viac ). Údaje sa získavali mesačne počas 2 až 3 týždňov s výnimkou decembra 2020 a augusta 2021, keď sa neuskutočnil žiadny prieskum. V každom kole zberu údajov boli menovaní jednotlivci zo zoznamu pacientov NHS registrovaných u praktického lekára v Anglicku pozvaní, aby sa zúčastnili štúdie na základe zoznamov získaných od NHS Digital.

Od 1. mája 2020 (začiatok 1. kola) do 3. mája 2021 (koniec 11. kola) sme sa zamerali na približne rovnaký počet účastníkov v každom z 315 miestnych orgánov nižšej úrovne v Anglicku (spája ostrovy Scilly s Cornwallom a City of London s Westminsterom), ale od 12. kola (20. mája až 7. júna 2021) sme upravili postup odberu vzoriek, aby sme získali náhodnú vzorku v pomere k populácii na úrovni miestnych orgánov nižšej úrovne. Tým sa zvýšil odber vzoriek v mestských oblastiach s vyššou hustotou obyvateľstva, hoci hlásenia o prevalencii neboli ovplyvnené, pretože sme údaje v každom kole vážili tak, aby boli reprezentatívne pre Anglicko ako celok (popísané nižšie).

RT-PCR testovanie a údaje o očkovaní

Účastníci poskytli výter z hrdla a nosa, ktorý si sami podali (alebo rodič alebo opatrovník dostal výter pre deti vo veku 5 – 12 rokov) podľa písomných a video pokynov. Výtery boli odoslané do centrálneho laboratória na analýzu pomocou RT-PCR. Extrahovaná nukleová kyselina bola analyzovaná na prítomnosť alebo neprítomnosť SARS-CoV-2 pomocou súpravy ViroBOAR 1·0 RT-qPCR (Eurofins Genomics, GmbH, Ebersberg, Nemecko) na SARS-CoV{{10 }} na Roche Lightcycler 480 II na paralelnú detekciu dvoch génových cieľov: génu N a génu E. Test má špecificitu blízku 100 percentám a limit detekcie desať kópií na mikroliter. Vzorky sa považovali za pozitívne buď vtedy, ak boli detegované dva génové ciele (gén N a gén E), alebo ak bol gén N detegovaný s hodnotou prahu cyklu (Ct) menšou ako 37.

Pre 14. kolo sme upravili spôsob, akým sa zaobchádzalo so vzorkami tampónov. Od 1. kola (začínajúceho 1. mája 2020) do 13. kola (končiace sa 12. júla 2021) sme na testovanie RT-PCR používali suché tampóny odoslané do laboratória chladené kuriérom. V 14. kole sme prešli na vlhké tampóny vo fyziologickom roztoku, ktoré sa potom náhodne prideľovali v pomere 1:1, aby boli odoslané kuriérom (n=46 705 platných tampónov sa vrátilo) alebo poštou (n{{12} }).

V rámci štúdie REACT-1 sme získali údaje o veku, pohlaví, adrese a poštovom smerovacom čísle bydliska z registra NHS s ďalšími informáciami o demografii, zdravotnom stave (vrátane stavu očkovania podľa vlastného uváženia) a životnom štýle odvodenými z online alebo telefonický dotazník. Účastníci boli požiadaní o súhlas na prepojenie s ich záznamami NHS vrátane údajov z programu imunizácie COVID-19. Stav očkovania z prepojenia údajov sa odvodil s predpokladom, že jedna dávka bude účinná až 14 dní alebo viac po injekcii. Neočkovaní ľudia boli preto definovaní ako tí, ktorí nedostali žiadnu dávku vakcíny alebo dostali jednu dávku menej ako 14 dní pred výterom; jednorazovo očkovaní ľudia boli definovaní ako tí, ktorí dostali jednu dávku 14 dní alebo viac pred výterom a buď žiadnu druhú dávku alebo druhú dávku menej ako 14 dní pred výterom, a ľudia, ktorí dostali dve dávky vakcíny, boli definovaní ako tí, ktorí dostali svoju druhú dávku 14 dní alebo viac pred výterom.

Sekvenovanie vírusového genómu

Po testovaní RT-PCR boli pozitívne vzorky s hodnotami Ct génu N menej ako 34 a s dostatočným množstvom materiálu zmrazené a odoslané na sekvenovanie vírusového genómu v Quadram Institute, Norwich, UK. Na amplifikáciu vírusovej RNA sa použil sekvenčný protokol ARTIC SARS-CoV-28 a na prípravu sekvenčných knižníc sa použila platforma CoronaHiT.9 Na analýzu údajov o sekvenovaní sa použil bioinformatický pipeline ARTIC10 a priradili sa línie s PangoLEARN.11

Štatistické analýzy

Štatistické analýzy boli vykonané v softvéri R (verzia R 4.{1}.5 (31. 3. 2021, Shake and Throw). Vypočítali sme neváženú prevalenciu SARS-CoV-2 podľa sociodemografických, pracovných a iných skupín vydelením počtov pozitivity výterov (z RT-PCR) počtom vrátených platných výterov.Použili sme váženie okrajov12, aby sme získali prevalenciu váženú tak, aby bola reprezentatívna pre populáciu Anglicka ako celku.

Na analýzu trendov pozitivity tampónov v priebehu času sme použili exponenciálny model rastu alebo úpadku. Predpokladali sme, že počet pozitívnych vzoriek (z celkového počtu vzoriek) každý deň pochádza z binomického rozdelenia na základe dňa výteru alebo, ak nie je k dispozícii, dňa odberu vzorky (kuriér) alebo prvého skenovania vzorky Pošta, ak sa posiela poštou. Odhadli sme zadné vierohodné intervaly (CrIs) pomocou bivariačného no-U-Turn Sampler za predpokladu rovnomerných predchádzajúcich distribúcií pravdepodobnosti pozitivity výteru v deň nula a rýchlosti rastu.13 Odhadli sme reprodukčné číslo (R) za predpokladu, že čas generovania bol gama distribuovaný s parametrom tvaru n=2·29 a parametrom rýchlosti =0·36 (zodpovedá priemernej dobe generovania 6·29 dní).14

Prispôsobili sme Bayesovský penalizovaný-spline (P-spline) model16 denným údajom pomocou údajov zo všetkých kôl REACT-1. Na odhad dennej prevalencie pozitivity výteru sa použil vzorkovač bez otáčania v logitovom priestore, pričom údaje boli segmentované do približne 5-dňových sekcií pomocou pravidelne rozmiestnených uzlov (poskytujúcich primeranú rovnováhu medzi časovým rozlíšením a výpočtovou realizovateľnosťou), a ďalšie uzly zahrnuté po období štúdie, aby sa minimalizovali okrajové efekty. Tiež sme prispôsobili P-spline k údajom REACT-1 stratifikovaným podľa veku, ako je uvedené vyššie, v ktorých bol P-spline prispôsobený samostatne pre každú vekovú skupinu, ale vyhladzovací parameter ρ sa považoval za najlepšiu získanú hodnotu. pre model vyhovuje všetkým údajom. Kvôli prehľadnosti, aj keď sú odhady založené na úplnej množine údajov REACT{10}}, uvádzame len odhady pre dni zberu 14. kola.

Účinnosť vakcíny proti infekcii SARS-CoV-2 sme odhadli kombináciou údajov z 13. a 14. kola, aby sme zvýšili štatistickú silu. Účinnosť vakcíny sme odhadli ako 1–odds ratio (OR), kde OR bol získaný z logistického regresného modelu rizika pozitivity výteru u dvojito očkovaných (tj tých, ktorí dostali dve dávky, pričom druhá dávka bola podaná viac ako 14 dní). pred výterom) a neočkovaní jedinci s úpravou na kolo, potom dodatočne na vek a pohlavie a ďalšiu úpravu na index kvintilu viacnásobnej deprivácie a etnickej príslušnosti. Získali sme súhlas pre etiku výskumu od Etického výboru pre výskum South Central-Berkshire B (Integrated Research Application System [IRAS] ID: 283787).

výhody extraktu z cistanche

Výsledky

Z 822 176 jednotlivcov pozvaných na účasť v 14. kole sa 147 393 (17,9 percenta) zaregistrovalo a 100527 (12,2 percenta) poskytlo tampón s platným výsledkom RT-PCR, pričom 87966 (87,5 percenta) súhlasilo s prepojením údajov . V 13. kole bolo pozvaných 841227 účastníkov; 147 332 zaregistrovaných a 98 233 (66,7 percent) z nich poskytlo výter s platným výsledkom RT-PCR. Výsledkom spojenia prepojených údajov z oboch kôl bolo 172 862 účastníkov, vrátane 102 142 (49 923 v 13. kole a 52 219 v 14. kole) vo veku 18 – 64 rokov, ktorí boli zahrnutí do našich analýz účinnosti vakcín (príloha p 7). Opis charakteristík účastníkov REACT-1 z 13. a 14. kola ukázal, že tí, ktorí súhlasili s prepojením údajov, boli s väčšou pravdepodobnosťou muži vo veku 45 rokov alebo starší, ktorí nežijú v Londýne, White, z jedného osoby v domácnosti a mali skúsenosti so symptómami súvisiacimi s COVID{33}}. Väčšina týchto rozdielov bola relatívne malá (príloha p 2). Vo výteroch odobratých kuriérom bola prevalencia o niečo vyššia a hodnoty Ct pre pozitívne vzorky o niečo nižšie ako vo výteroch odoslaných poštou (príloha str. 3, 8).

Z 100527 platných výterov v 14. kole bolo 764 pozitívnych, čo predstavuje prevalenciu 0·83 percent (95 percent CrI 0·76–{{ 57}}·89) vážené ako reprezentatívne pre populáciu Anglicka (príloha p 4). Najvyššia vážená prevalencia počas 2. septembra0}21 bola pozorovaná u tínedžerov vo veku 13–17 rokov, a to 2,55 percent (95 percent CrI 2,11–3,08) au detí vo veku 5–12 rokov, na 2,32 percentách (1,96–2,73; tabuľka 1, príloha p 9). P-spline pre 14. kolo, prispôsobené údajom zo všetkých kôl REACT{33}}, naznačoval stabilný alebo rastúci trend v prevalencii pozitivity výteru (obrázok 1A), pričom R sa odhaduje na 1·{{68} }3 (95 percent CrI 0·94–1·14) vo všetkých vekových skupinách spolu (tabuľka 2). Prispôsobené P-splines ukázali zvyšujúcu sa prevalenciu vo veku 5–11 rokov a klesajúcu prevalenciu vo veku 18–54 rokov (obrázok 1B), s vyššou ako 99-percentnou zadnou pravdepodobnosťou, že rýchlosť rastu sa medzi týmito dvoma skupinami líši. Zodpovedajúce R bolo 1,42 (95 percent CrI 1,18–1,68), s vyššou ako 0·99 posteriórnou pravdepodobnosťou, že R bolo väčšie ako 1 vo veku 5–11 rokov; R bolo 0·95 (0·76–1·16), so zadnou pravdepodobnosťou 0,32, že R bolo väčšie ako 1 u osôb vo veku 12–17 rokov; a R bolo 0,81 (0,68–0,97), so zadnou pravdepodobnosťou 0,01, že R bolo väčšie ako 1 u osôb vo veku 18–54 rokov (tabuľka 2).

Weighted prevalence also varied by region (table 1; appendix p 9), ranging from 0·57% (95% CrI 0·45–0·72) in the South East to 1·25% (1·00–1·57) in Yorkshire and The Humber. Within round 14, there was evidence of epidemic growth (with a posterior probability greater than 0·99 that R>1) v Londýne s R 1,59 (95 percent CrI 1,23–1,99) a v East Midlands s R 1,36 (1,05–1,73; tabuľka 2) .

Zistili sme vyššiu váženú prevalenciu pozitivity výterov medzi účastníkmi černošského etnika, 1,41 percenta (95 percent CrI 0·91–2·19), v porovnaní s bielymi účastníkmi v 0 ·78 percent (0·72–0·85; tabuľka 1). Účastníci žijúci vo väčších domácnostiach mali vyššiu váženú prevalenciu ako tí v menších domácnostiach, a to v rozmedzí od 0·33 percent (95 percent CrI 0·25–{19}}·44) pre jednu osobu domácnosti na 1,75 percenta (1,24–2,46) v prípade domácností so šiestimi alebo viacerými jednotlivcami (tabuľka 1). Prevalencia bola tiež vyššia v domácnostiach s jedným alebo viacerými deťmi, a to 1,37 percenta (95 percent CrI 1,22–1,52), v porovnaní s 0·40 percentami ({{4{ {49}}}}·35–0·46) pre domácnosti bez detí; a vážená prevalencia bola 7,35 percent (6,50–8,31) medzi tými, ktorí uviedli, že boli v kontakte s potvrdeným prípadom COVID{48}}, v porovnaní s 0,43 percentami (0,38 –0,49) medzi tými, ktorí takýto kontakt nemajú (tabuľka 1).

Použitím vlastného hláseného stavu očkovania sme zistili vyššiu prevalenciu u neočkovaných účastníkov (všetky vekové kategórie), 1,73 percenta (95 percent CrI 1,42–2,12), v porovnaní s tými, ktorí hlásili dve dávky vakcíny, v {{8 }}·56 percent ({{10}}}·50–0·62; tabuľka 1).

V multivariabilnej logistickej regresnej analýze mali kľúčoví pracovníci iní ako zdravotnícki pracovníci a pracovníci opatrovateľských domovov zvýšené riziko pozitivity výteru v porovnaní s ostatnými pracovníkmi (OR 1,35 [95 percent CI 1,10–1,66]; tabuľka 3) . Pozitivita výteru bola tiež vyššia s rastúcou veľkosťou domácnosti (vzájomne upravené OR 1,77 [95 percent CI 1,44–2,17] pre domácnosti s tromi až piatimi osobami a 2,37 [1,62–3,47] pre domácnosti šesť a viac osôb) v porovnaní s domácnosťami s jednou alebo dvoma osobami.

Zhromaždili sme prepojené údaje o vakcínach z kôl 13 a 14 (celkovo 172 862 účastníkov, 19 325 vo veku<18 years,="" 102142="" aged="" 18–64="" years,="" and="" 51395="" aged="" ≥65="" years).="" because="" of="" the="" relatively="" small="" numbers="" of="" individuals="" vaccinated="" below="" the="" age="" of="" 18="" years,="" corresponding="" participants="" (n="19325)" were="" excluded="" from="" our="" vaccine="" effectiveness="" analyses.="" weighted="" prevalence="" was="" higher="" for="" those="" who="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" than="" for="" those="" whose="" second="" dose="" was="" up="" to="" 3="" months="" before="" their="" swab="" (0·55%="" [95%="" cri="" 0·50–0·61]="" vs="" 0·35%="" [0·31–0·40];="" figure="" 2a;="" appendix="" p="" 5).="" the="" weighted="" prevalence="" for="" individuals="" whose="" second="" dose="" was="" administered="" more="" than="" 6="" months="" before="" their="" swab="" was="" similar="" to="" that="" of="" those="" vaccinated="" within="" 3–6="" months="" of="" their="" swab,="" at="" 0·52%="" (95%="" cri="" 0·33–0·78),="" but="" with="" a="" wider="" credible="" interval.="" the="" age="" distribution="" of="" participants="" by="" vaccination="" status="" indicated,="" as="" expected="" from="" the="" age-based="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" aged="" 35="" years="" and="" older="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses="" compared="" to="" those="" who="" had="" received="" a="" single="" dose,="" or="" those="" who="" were="" unvaccinated="" (appendix="" p="" 5).="" nevertheless,="" among="" those="" who="" had="" received="" two="" vaccine="" doses,="" we="" observed="" similar="" age="" distributions="" in="" people="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" or="" more="" than="" 6="" months="" before="" swabbing.="" regardless,="" in="" individuals="" aged="" 18="" years="" and="" older="" with="" linked="" data="" on="" vaccination="" status,="" the="" weighted="" prevalence="" in="" unvaccinated="" people,="" at="" 1·76%="" (95%="" cri="" 1·60–1·95),="" was="" three="" to="" five="" times="" higher="" than="" in="" double-vaccinated="" individuals,="" at="" 0·47%="" (0·43–0·51).="" reflecting="" the="" rollout="" of="" the="" vaccine="" program="" in="" england,="" a="" higher="" proportion="" of="" individuals="" who="" were="" unvaccinated="" or="" who="" had="" a="" single="" dose="" of="" the="" vaccine="" were="" younger="" (≤54="" years)="" than="" those="" with="" two="" doses="" (figure="" 2b;="" appendix="" p="" 5).="" however,="" in="" double-vaccinated="" participants,="" there="" was="" an="" apparent="" trend="" of="" increasing="" weighted="" prevalence="" in="" each="" age="" group="" for="" those="" who="" had="" received="" their="" second="" dose="" 3–6="" months="" before="" their="" swab="" compared="" to="" those="" who="" were="" vaccinated="" up="" to="" 3="" months="" before="" (figure="">

Odhady účinnosti očkovacej látky boli odvodené z prepojeného súboru údajov pre kolá 13 a 14 v kombinácii len pre jednotlivcov vo veku 18 – 64 rokov, pretože málo ľudí starších ako 65 rokov bolo neočkovaných (1,1 percenta), a ako bolo uvedené, len málo ľudí mladších ako 18 rokov rokov (6,3 percenta v 13. a 14. kole spolu). U všetkých jedincov vo veku 18 – 64 rokov a všetkých vakcín dohromady bola účinnosť vakcíny proti infekcii 66,3 percenta (95 percent CI 55,3 až 74,7), s úpravou na kolo, a 62,8 percenta (49,3- 72·7) v plne upravenom modeli. Úplne upravené bodové odhady účinnosti vakcín pre vakcíny BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) a mRNA{29}} (Moderna) boli porovnateľné (71,3 percenta oproti 75,1 percenta, s oveľa širším intervalom spoľahlivosti pre mRNA{{34 }} [Moderná] vakcína v dôsledku menšieho počtu pozorovaní) a vyššia, ako sa odhaduje pre vakcínu ChAdOx1 nCov-19 (Oxford–AstraZeneca) (44,8 percent). Rozdiely v odhadoch účinnosti vakcín podľa typu vakcíny však nedosiahli štatistickú významnosť na 0·05 hladine významnosti. Zahrnutie interakčného termínu pre vakcínu do kola nenaznačovalo, že by sa účinky modifikovali v kolách 13 a 14 (údaje nie sú uvedené). Odhady účinnosti vakcíny v modeloch obmedzených na symptomatické prípady boli podobné ako v modeloch, ktoré zahŕňali aj asymptomatické prípady (tabuľka 4).

Línie zo 475 (62,2 percenta) vzoriek sekvenovaných medzi 764 pozitívnymi tampónmi boli všetky delta varianty alebo sublínie delta. AY.4 bola najviac zistená podlínia, ktorá predstavovala 61,5 percenta (95 percent CI 57·0–65,7) zo sekvenovaných vzoriek a bolo tam sedem vzoriek s jednoduchými vrcholovými mutáciami podľa definície Public Health England (teraz Agentúra pre zdravotnú bezpečnosť Spojeného kráľovstva): Glu484Lys, Asn501Tyr, Phe490Ser, Arg246Gly, Val483Phe, Pro251Leu a Gln613His (príloha p 6). Identifikovali sme 22 vzoriek (osem s líniou B.1.617.2 a 14 s líniou AY.4) vrátane mutácie Tyr145His v spike proteíne spojenej s delta sublíniou AY.4.2, čo zodpovedá 4,63 percentám (95 percent CI 3·07–6·91) všetkých línií určených.

zlepšenie imunity cistanche kapsuly

Diskusia

V tomto štrnástom kole štúdie REACT-1 sme zistili vysokú a zvyšujúcu sa prevalenciu pozitivity výteru SARS-CoV-2 medzi deťmi školského veku v Anglicku počas septembra 2021, čo odráža zvýšené sociálne miešanie detí chodili do školy na jesenný semester. Zároveň sme zistili klesajúcu prevalenciu medzi mladými dospelými až stredným vekom (18–54 rokov). Toto pozorovanie môže odrážať účinok predchádzajúcej prirodzenej infekcie, najmä medzi mladšími dospelými, u ktorých bola miera infekcie vysoká17, a pokračujúce zavádzanie očkovacieho programu v Anglicku. Od apríla 2021 bol národný program očkovania proti COVID{10}} rozšírený o dospelých mladších ako 50 rokov18, od augusta 2021 jednu dávku vakcíny pre starších tínedžerov (vo veku 16 – 17 rokov) a jednu dávku pre deti vo veku 12 – 15 rokov od polovice septembra 2021.

Od polovice do konca decembra 2021 sa všetkým deťom vo veku 12 rokov a starším ponúka druhá dávka vakcíny a tretia (posilňovacia) dávka sa zavádza pre dospelú populáciu vo veku 18 rokov a viac. Rovnako ako v našej predchádzajúcej správe19 (13. kolo) sme zistili, že všetky sekvenované výtery boli z delta variantu a jeho podlínií, čo naznačuje takmer úplné nahradenie alfa a iných variantov delta v Anglicku v tom čase. Zistili sme jednu potenciálnu únikovú mutáciu Glu484Lys, ktorá sa premieta do odhadovaných 984 takýchto infekcií v Anglicku s nižšou 95-percentnou hranicou spoľahlivosti 159. Celkovo bolo sedem vzoriek s jednotlivými bodovými mutáciami, ktoré sú predmetom záujmu, ako to definovalo Public Health England. Ďalších 22 vzoriek zahŕňalo mutáciu Tyr145His v spike proteíne spojenom s podlíniou AY.4.2.

Zodpovedajúci podiel AY.4 4,63 percent (95 percent CI 3,07-6,91) vo všetkých líniách je v súlade so 6 percentami prípadov hlásených Public Health England v týždni začínajúcom 27. septembra 2021.20 Očkovanie má sa ukázalo ako vysoko účinné proti závažným komplikáciám COVID{12}} vrátane prijatia do nemocnice a úmrtia, ale pokiaľ ide o ochranu pred infekciou, je menej jasné. Hoci boli na základe rutinného testovania symptomatických jedincov hlásené odhady účinnosti vakcíny proti infekcii až 90 percent,21 tu uvádzame odhad účinnosti vakcíny proti infekcii 63 percent z 13. a 14. kola REACT{16}}, kedy dominoval delta variant.

Toto zistenie je podobné tomu, čo bolo uvedené v prepojených údajoch len pre kolá 13,19 ale spojením údajov z oboch kôl 13 a 14 sme tiež dokázali odhadnúť účinnosť vakcíny pre ChAdOx1 nCov-19 (Oxford – AstraZeneca) a vakcíny BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) samostatne. Hoci sa intervaly spoľahlivosti prekrývajú, naše výsledky naznačujú vyššiu účinnosť proti infekcii vakcínou BNT162b2 (Pfizer–BioNTech) ako vakcínou ChAdOx1 nCov-19 (Oxford–AstraZeneca). Väčšie rozdiely medzi vakcínami boli zaznamenané v predchádzajúcej štúdii22 a Public Health England (teraz UK Health Security Agency [UK HSA]) na základe rutinného testovania symptomatických prípadov.23 Napriek tomu je potrebné poznamenať, že účinnosť vakcíny je špecifická pre populáciu a čas, takže tieto odhady odrážajú výkonnosť vakcín v Anglicku počas konkrétneho časového obdobia (tj jún – september 2021). Odvtedy sa omikrónový (B.1.1.529) variant stal dominantným v Anglicku do decembra 2021, pričom štúdie HSA Spojeného kráľovstva poukazujú na nižšiu účinnosť vakcíny proti symptomatickej infekcii pre omikrón v porovnaní s delta.24

Naša štúdia ukazuje, že prevalencia pozitivity výteru medzi neočkovanými jedincami (vrátane všetkých detí vo veku 5–11 rokov) alebo jedincami, ktorí dostali jednu dávku vakcíny (vrátane detí vo veku 12–17 rokov) bola trikrát až štyrikrát vyššia ako u dvakrát očkovaných osôb. , ale tiež naznačuje, že prevalencia pozitivity výteru indikujúca prelomové infekcie po dvojdávkovej vakcinácii sa môže zvýšiť po 3–6 mesiacoch. Okrem toho sme zistili, že ľudia žijúci vo väčších domácnostiach a ľudia žijúci v domácnostiach s deťmi mali vyššiu mieru pozitivity výterov ako ľudia v menších domácnostiach alebo ľudia bez detí v domácnosti. Zistenie najvyšších hladín váženej prevalencie v pozitivite výteru počas 14. kola u detí vo veku 5–11 rokov a 12–17 rokov vyvoláva obavy u klinicky extrémne zraniteľných detí, ako aj u klinicky extrémne zraniteľných blízkych kontaktov, vrátane členov domácnosti a zamestnancov školy.

Od konca decembra 2021 budú klinicky zraniteľným deťom vo veku 5 – 11 rokov ponúkané dve dávky vakcíny. Existujú tiež obavy z vplyvu na vzdelanie pre veľký počet detí, ktoré musia byť mimo školy, keď sú pozitívne testované v dôsledku vysokej miery infekcie SARS-CoV-2. Zistenie, že prevalencia bola viac ako trikrát vyššia u jednotlivcov v domácnostiach s jedným alebo viacerými deťmi ako u jednotlivcov v domácnostiach bez detí, naznačuje, že infekcie u detí sa neprekvapivo rozšírili do iných vekových skupín. Vyššie vírusové záťaže spojené s variantom delta u mladších jedincov v porovnaní so skoršími variantmi25–27 môžu tiež zvýšiť účinnosť prenosu detí, a preto prispieť k vyšším infekciám v domácnostiach. K 27. septembru 2021 bolo v štúdii REACT{15}} zaočkovaných iba 1214 (6,3 percenta) detí vo veku 12 – 17 rokov, čo neumožnilo zmysluplné rozšírenie našich analýz účinnosti vakcín na túto vekovú skupinu v roku kolo 14.

Ďalšie štúdie účinnosti vakcíny sú zaručené vzhľadom na rýchly nárast omikrónových infekcií v Anglicku od decembra 2021 a zavedenie očkovania dvojitými dávkami pre školákov vo veku 12 až 15 rokov, posilňovacie dávky vo veku 16 až 17 rokov a dospelých. vo veku 18 rokov a viac. Okrem toho komunitné štúdie, ako napríklad REACT-1, umožňujú odhad účinnosti vakcíny proti infekcii u osôb s asymptomatickými, ako aj symptomatickými infekciami. Hoci po očkovacej kampani došlo v Anglicku k relatívnemu nesúladu medzi infekciami SARS-CoV{10}} a prijatím do nemocnice a úmrtiami2, pretrvávajú obavy, že vysoká miera infekcií a neúplná imunita obyvateľstva povedie k zvýšenému riziku závažné komplikácie COVID-19. Anglicko, spolu so zvyškom Spojeného kráľovstva a niekoľkými ďalšími krajinami (najmä Izrael28), sa pustilo do kampane na zavedenie tretej (posilňovacej) dávky – od októbra 2021 v Anglicku. Spočiatku to zahŕňalo uprednostňovanie dospelých vo veku 50 rokov a starších, zdravotníckych a sociálnych pracovníkov a ohrozených mladších ľudí, no zavádzanie sa následne od konca decembra 2021 rozšírilo na všetkých dospelých vo veku 18 rokov a starších.29 Priebežné monitorovanie epidémia v Anglicku a inde bude dôležitá na zmeranie, do akej miery posilňovacie dávky u dospelých a očkovanie u detí obmedzujú prenos nových variantov SARS-CoV-2, ktoré vyvolávajú obavy, ako je omikrónový variant.

Naša štúdia má obmedzenia. Odkedy sa v štúdii REACT{0}} začalo so zberom údajov v máji 2020, pozorovali sme postupné znižovanie miery odpovedí z 30,5 percenta v 1. kole na 11,7 percenta v 13. kole. V 14. kole sa však miera mierne vzrástla na 12,2 percenta. Toto zvýšenie, aj keď malé, je povzbudzujúce. Je možné, že ďalšie zmeny v prieskume by mohli ešte viac zvýšiť účasť. Zmena na používanie vlhkých tampónov vo fyziologickom roztoku a odber vzoriek bez chladiaceho reťazca (poštou alebo kuriérom) mohla ovplyvniť diagnostickú citlivosť. Upokojili nás obmedzené rozdiely medzi vzorkami zozbieranými poštou a kuriérom.

Keďže však presný systém použitý v predchádzajúcich kolách (suché tampóny a trvalý chladiaci reťazec) nebol porovnaný v rámci približne, nemohli sme odhadnúť vplyv nového prístupu v porovnaní s tým, ktorý sa použil v predchádzajúcich kolách. Ďalším obmedzením je, že nemáme presné údaje o stave očkovania všetkých účastníkov. Hoci súhlas na prepojenie údajov bol na vysokej úrovni (87,5 percenta v 14. kole), nie všetci účastníci súhlasili s prepojením so svojimi záznamami NHS, ktoré zahŕňajú údaje z imunizačného programu COVID-19. Pre tých, ktorých údaje nie sú prepojené, údaje o dátumoch očkovania a type vakcíny buď chýbajú, alebo sú menej spoľahlivé ako v prepojených údajoch; preto sme naše odhady účinnosti vakcín založili na podskupine účastníkov s prepojenými záznamami. Tento prístup mohol zaviesť zaujatosť do tej miery, že tí, ktorí súhlasia a nesúhlasia s prepojením údajov, sa môžu líšiť v dôležitých ohľadoch, ako sú vzorce sociálneho miešania, ktoré by mohli ovplyvniť riziko infekcie.

Okrem toho, pre naše odhady účinnosti vakcín podľa typu vakcíny, aj keď sme v našej vzorke kontrolovali vek a kolo, amplitúda rozdielov medzi vakcínami môže byť prehnaná. Je to preto, že existovali rôzne modely podávania vakcíny špecifické pre vek (s vakcínou ChAdOx1 n Cov-19 [Oxford–AstraZeneca], ktorá bola primárne podávaná ľuďom vo veku nad alebo rovným 40 rokov), ako aj rozdiely v dynamiku prenosu pre vekové skupiny, ktoré dostali rôzne vakcíny. REACT-1 nebol k dispozícii počas augusta 2021, takže medzi koncom 13. kola 12. júla a začiatkom 14. kola 9. septembra 2021 došlo k oneskoreniu takmer 2 mesiace.

Aj keď je možné, že sa odhady účinnosti vakcíny môžu počas tohto obdobia líšiť, nenašli sme dôkaz o interakcii medzi okrúhlym a vakcínovým efektom. Na záver sme našli dôkaz o zvyšujúcej sa prevalencii pozitivity výteru u detí školského veku, ako aj o vyššej prevalencii pozitivity výteru 3–6 mesiacov po dvojdávkovom očkovaní proti COVID-19 u dospelých. Pokračujúce snahy o očkovanie detí školského veku a podanie posilňovacej dávky všetkým dospelým vo veku 18 rokov a starším by mali pomôcť čeliť akémukoľvek zníženiu imunity na úrovni jednotlivca aj populácie. V zimnej sezóne v Anglicku je NHS zvyčajne pod tlakom chrípky a iných vírusov, čo sa zhoršilo v decembri 2021 v dôsledku rýchleho nárastu omikrónových infekcií. Je preto dôležité, aby si očkovací program udržal vysoké pokrytie vrátane preočkovania a dosiahol vysoký podiel detí a neočkovaných alebo čiastočne očkovaných dospelých, aby sa znížil prenos SARS-CoV-2 a s tým spojené prerušenia práce a vzdelávania.

doplnok cistanche tubolosa: zlepšenie imunity

Referencie

1 Spoločný výbor pre očkovanie a imunizáciu. Poradenstvo o prioritných skupinách pre očkovanie proti COVID{1}}, 30. decembra 2020.

2 Riley S, Wang H, Eales O, a kol. REACT-1 správy z 12. kola: opätovný výskyt infekcií SARS-CoV-2 v Anglicku spojený so zvýšenou frekvenciou variantu Delta. medRxiv 2021; zverejnené online 21. júna.

3 NHS Anglicko. očkovanie proti COVID-19.

4 Ministerstvo školstva Spojeného kráľovstva. Usmernenie: akcie pre školy počas vypuknutia koronavírusu. 2. júla 2020.

5 Správy BBC. Prví škótski žiaci späť v škole na nový semester za úrovňou nula. BBC.

6 Riley S, Ainslie KEC, Eales O, a kol. Oživenie SARS-CoV-2: detekcia komunitným vírusovým dohľadom. Veda 2021; 372: 990-95.

7 Riley S, Atchison C, Ashby D, a kol. Hodnotenie komunitného prenosu vírusu SARS-CoV-2 v reálnom čase: protokol štúdie. Vitajte Open Res 2020; 5:200.

8 Quick J. nCoV-2019 sekvenčný protokol v3 (Locost). 2020; zverejnené online 25. augusta. https://www.protocols.io/view/ncov-2019- sequencing-protocol-v3-Locost-bh42j8ye (prístup 4. mája 2021).

9 Baker DJ, Aydin A, Le-Viet T a kol. CoronaHiT: vysokovýkonné sekvenovanie genómov SARS-CoV-2. Genome Med 2021; 13:21.

10 [Nie sú uvedení žiadni autori]. Potrubie Nextflow na prevádzkovanie nástrojov terénnej bioinformatiky siete ARTIC. Github.

11 [Nie sú uvedení žiadni autori]. Fylogenetické priradenie pomenovaných línií globálneho ohniska (PANGOLIN). Github.

12 Sharot T. Váženie výsledkov prieskumu. J Mark Res Soc 1986; 23: 269-84. 13 Hoffman MD, Gelman A. Vzorkovač bez otáčania: adaptívne nastavenie dĺžok dráhy v hamiltonovskom Monte Carle. J Mach Learn Res 2014; 15: 1533-623.

14 Bi Q, Wu Y, Mei S, a kol. Epidemiológia a prenos COVID-19 v 391 prípadoch a 1286 ich blízkych kontaktov v Shenzhene, Čína: retrospektívna kohortová štúdia. Lancet Infect Dis 2020; 20: 911–19.

15 Wallinga J, Lipsitch M. Ako generačné intervaly formujú vzťah medzi rýchlosťou rastu a reprodukčným počtom. Proc Biol Sci 2006; 274: 599-604.

16 Lang S, Brezger A. Bayesian P-Splines. J Compput Graph Stat 2004; 13: 183-212.

17 Úrad pre národnú štatistiku. Najnovšie poznatky o koronavíruse (COVID-19): infekcie. 7. januára 2022.

18 Ministerstvo zdravotníctva a sociálnej starostlivosti Spojeného kráľovstva. Tlačová správa: Spojené kráľovstvo prechádza do ďalšej fázy zavádzania vakcín, keďže vládny cieľ bol zasiahnutý skoro. 13. apríla 2021.

19 Elliott P, Haw D, Wang H a kol. Exponenciálny rast, vysoká prevalencia SARS-CoV-2 a účinnosť vakcíny spojená s variantom Delta. Veda 2021; 374: eabl9551.

20 Agentúra pre zdravotnú bezpečnosť Spojeného kráľovstva. Varianty SARS-CoV-2 a varianty, ktoré sú predmetom vyšetrovania v Anglicku. Technický brífing 25. 15. okt. 2021.

21 Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, a kol. Účinnosť vakcín Covid-19 proti variantu B.1.617.2 (Delta). N Engl J Med 2021; 385: 585-94.

22 Pouwels KB, Pritchard E, Matthews PC a kol. Účinok variantu Delta na vírusovú záťaž a účinnosť vakcíny proti novým infekciám SARS-CoV-2 v Spojenom kráľovstve. Nat Med 2021; zverejnené online

23 Verejné zdravie Anglicko. Správy o dohľade nad očkovaním COVID{1}} (19. až 38. týždeň). 14. mája 2021.

24 Agentúra pre zdravotnú bezpečnosť Spojeného kráľovstva. Varianty SARS-CoV-2 a varianty, ktoré sú predmetom vyšetrovania v Anglicku. Technický brífing: aktuálne informácie o hospitalizácii a účinnosti vakcíny pre Omicron VOC-

25 Jones TC, Biele G, Mühlemann B, a kol. Odhad infekčnosti počas priebehu infekcie SARS-CoV-2. Veda 2021; 373: eabi5273.

26 Bellon M, Baggio S, Jacquerioz Bausch F, a kol. Kinetika vírusovej záťaže koronavírusu 2 (SARS-CoV-2) u symptomatických detí, dospievajúcich a dospelých. Clin Infect Dis 2021; 73: e1384–86.

27 Li B, Deng A, Li K a kol. Vírusová infekcia a prenos vo veľkom, dobre vysledovateľnom ohnisku spôsobenom variantom SARS-CoV-2 Delta. MedRxiv 2021; zverejnené online 23. júla.

28 Bar-On YM, Goldberg Y, Mandel M, a kol. Ochrana posilňovacej vakcíny BNT162b2 proti Covidu-19 v Izraeli. N Engl J Med 2021; 385: 1393–400.

29 Agentúra pre zdravotnú bezpečnosť Spojeného kráľovstva. Očkovanie proti COVID-19: Sprievodca posilňovacou vakcináciou pre jednotlivcov vo veku 40 rokov a viac.