Extrachromozomálne cirkulárne DNA bez močových buniek: Možný biomarker pre chronické ochorenie obličiek

May 12, 2023

KĽÚČOVÉ SLOVÁ

bezbunková DNA, chronické ochorenie obličiek, circle-seq, diagnóza

Podľa relevantných štúdiícistancheje tradičná čínska bylina, ktorá sa po stáročia používa na liečbu rôznych chorôb. Bolo vedecky dokázané, že máprotizápalové,protistarnutie, aantioxidantvlastnosti. Štúdie ukázali, že cistanche je prospešný pre pacientov trpiacich naobličkychoroba. O aktívnych zložkách cistanche je známe, že znižujú zápal,zlepšiťobličkyfunkciuaobnoviť poškodené obličkové bunky. Začlenenie cistanche do plánu liečby ochorenia obličiek teda môže pacientom ponúknuť veľké výhody pri zvládaní ich stavu.Cistanchepomáha znižovať proteinúriu, znižuje hladinu BUN a kreatinínu a znižuje riziko ďalšieho poškodenia obličiek. Okrem toho cistanche tiež pomáha znižovať hladinu cholesterolu a triglyceridov, čo môže byť nebezpečné pre pacientov trpiacich ochorením obličiek.

cistanche lost empire

Kliknite na Cistanches Herba na ochorenie obličiek

Ďalšie informácie:

david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

Cirkulujúca bezbunková DNA (cfDNA) plávajúca v telesných tekutinách je intenzívna oblasť výskumu vzhľadom na ich potenciálne klinické využitie ako trieda biomarkerov minimálne invazívnych chorôb pre rôzne ľudské choroby. Hoci sa predpokladá, že cfDNA je hlavne vedľajším produktom apoptotických buniek (pričom hlavnými prispievateľmi sú hematopoetické bunky), uvádza sa tiež, že neustále uvoľňovanie nukleových kyselín je sofistikovaný spôsob medzibunkovej signalizácie počas vývoja, epigenetickej remodelácie, regenerácie tkanív a úprava adaptívneho imunitného systému.1 Doteraz bol výskum cfDNA väčšinou obmedzený na fragmentované lineárne molekuly DNA (< 200 base pairs [bp]). Recently, however, extrachromosomal circular DNAs (cDNAs) have gained considerable attention because of their ubiquitous prevalence in all eukaryotic cells. eccDNA is found in both physiological and pathological conditions, ranging from animals and plants to yeast sources, and has diverse origins. cDNAs are originated from and homologous to chromosomes, but once they are formed, they are likely to act independently. Although the formation and biological roles of eccDNA remain understudied, it is thought to reflect the genome's plasticity and instability.2 Similar to linear cf-DNA, eccDNA is demonstrated in human plasma and considered to be released into circulation after cell apoptosis/death and turnover, with a higher rate in diseased states. Due to their covalently bonded circular structure, extracellular eccDNAs are assumed to be more resistant to exonuclease degradation compared to their linear counterparts. Considerable research has been conducted on linear cf-DNA in blood, saliva, cerebrospinal fluid, and urine as an informative diagnostic tool3; however, the existence of eccDNA in human urine had not been discovered. In the recent issue of "Clinical and Translational Medicine", Lv et al. have demonstrated for the first time the presence of cell-free eccDNA (cf-eccDNA) in urine samples from healthy individuals and patients with advanced chronic kidney diseases (CKD).4 They analyzed urine samples from 28 healthy individuals and 21 patients with advanced CKD for characterization of urinary cf-eccDNA using a modified Circle-Seq method.

Zo vzoriek zdravých dobrovoľníkov bolo prezentovaných viac ako jeden milión jedinečných močových cf-eccDNA. Ako zaujímavé pozorovanie autori uvádzajú koreláciu medzi počtom eccDNA a génmi kódujúcich proteín, ostrovčekmi CpG, krátkymi rozptýlenými transponovateľnými prvkami a jednoducho opakujúcimi sa prvkami. Zistilo sa, že väčšina močových cf-eccDNA je menšia ako 1 000 bp a je obohatená o štyri hlavné píky umiestnené pri 207, 358, 553 a 732 bp. Zatiaľ čo značná časť ľudského chromozómu (14,9 percenta) prispela k tvorbe močového cf-eccDNA, chromozómy bohaté na gény vrátane chromozómov 17, 19 a 20 prispeli najvyššou mierou a chromozóm 21 s chudobným na gény prispel najmenej. Toto pozorovanie a predchádzajúce správy5,6 naznačujú silnú koreláciu medzi transkripčnou aktivitou a tvorbou eccDNA.

cistanche pros and cons

Zatiaľ čo niektoré biologické funkcie a chorobné stavy vrátane génovej regulácie, liekovej rezistencie, signálnej komunikácie, starnutia a tumorigenézy sú spojené s eccDNA7, o tom, ako vzniká cf-eccDNA, sa vie len málo. Preto lepšie pochopenie toho, ako sa tvorí eccDNA, nám môže umožniť vytvoriť nové diagnostické a terapeutické nástroje. V súlade s touto predstavou Lv a kol. prezentovali, že väčšinou (66,36 percent) existuje priama opakujúca sa sekvencia (4- až 18-bp) v blízkosti miest spojenia eccDNA spolu s párom trinukleotidových palindromických opakovaní s 4-bp "medzerníkmi" v medzi lemovaním počiatočného a koncového miesta eccDNA.4 Hoci väčšina eccDNA obsahuje priame opakujúce sa sekvencie a palindromické opakovania, čo poukazuje na možné zapojenie homologickej rekombinácie sprostredkovanej cirkularizácie a mikrohomológie sprostredkovaného procesu spájania koncov po zlomoch DNA a prispieva k nášmu pochopeniu Pri tvorbe eccDNA veľká časť eccDNA stále neobsahuje tieto opakovania, ktoré si vyžadujú ďalšiu mechanickú prácu na úplné objasnenie toho, ako/kedy sa tieto kruhové fragmenty DNA tvoria.

Zaujímavejšie je, že zatiaľ čo charakterizácia močovej cf-eccDNA bola podobná, pokiaľ ide o veľkosť, obsah GC a podpis motívu medzi zdravými jedincami a pacientmi, vzorky od pacientov s pokročilým CKD (štádium 3–5) odhalili vyššie hladiny cf-eccDNA v moči. v porovnaní so zdravými jedincami. Aj keď medzi skupinami bol rozdiel v parametri veku (pacienti s CKD boli relatívne starší), nezistila sa žiadna korelácia medzi vekom a množstvom cf-eccDNA, čo podporuje silnú súvislosť medzi úrovňou eccDNA a stavom CKD. Ďalšie skúmanie charakterizácie eccDNA od pacientov preukázalo často zistenú skupinu miRNA eccDNA u pacientov s CKD. Je celkom fascinujúce, že tieto obohatené gény kódujúce miRNA sú konzistentné u pacientov a sú spojené s poruchami obličiek a močových ciest.8,9 Tieto zistenia si teraz vyžadujú overenie prostredníctvom väčších kohortových klinických štúdií, ktoré zahŕňajú nielen pacientov s CKD v pokročilých štádiách, ale aj iných CKD. štádiách spolu s inými ochoreniami obličiek a močových ciest. Bolo by tiež zaujímavé preskúmať rôzne iné ako močové ochorenia, ako je rakovina a kosáčikovitá anémia, kde sa cfDNA bežne skúma a používa ako diagnostický nástroj.

cistanche flaccid

Tieto molekuly DNA pravdepodobne pochádzajú z obličiek, močového traktu, ako aj z plazmy. Vyššie hladiny močovej cf-eccDNA sú preto pravdepodobné u pacientov s CDK, ktorí majú vyššiu renálnu bunkovú apoptózu, poškodenie DNA a zápal u týchto pacientov. Hoci mnohé štúdie uvádzali prítomnosť cf-eccDNA v iných telesných tekutinách, táto štúdia navrhuje jeden možný mechanizmus, ako sa tieto kruhové DNA odstraňujú z tela. Metóda použitá v štúdii nemôže odlíšiť eccDNA od plazmy alebo močového traktu, toto pozorovanie a navrhovaná cesta klírensu pre plazmatickú eccDNA by sa mali potvrdiť v budúcich štúdiách.

Lv a kol. poskytnúť presvedčivú štúdiu o prvej správe o prítomnosti eccDNA v moči a navrhnúť potenciálnu diagnostickú metódu pre CKD. Tieto výsledky sú sľubné pre neinvazívny, priamy vývoj biomarkerového testu nielen pre CDK, ale pravdepodobne aj pre všetky ostatné apoptotické ochorenia (najmä obličkové a močové ochorenia). Keďže už bolo uvedené, že lineárne cf-DNA vo vzorkách moču sú vysoko degradované10 a v tejto štúdii boli preukázané rôzne profily cf-eccDNA medzi pacientmi, ďalšie štúdie sú vysoko opodstatnené, aby preukázali stabilitu/spoľahlivosť kruhovej DNA v moči a použiteľnosť detekčnej metódy ako diagnostického nástroja. Tieto štúdie by sa mali rozšíriť na pacientov s počiatočnými štádiami ochorenia, aby sa preskúmal potenciál prevencie recidívy ochorenia, včasnej detekcie, stratifikácie rizika, výberu optimálnej terapie a monitorovania úspechu/reakcie na liečbu.

which cistanche is best

POĎAKOVANIE

Autor ďakuje Dr. Alexis Leonard za jej cenné pripomienky k článku.

KONFLIKT ZÁUJMOV

Autor vyhlasuje, že neexistuje potenciálny konflikt záujmov.

LITERATÚRA

1. Ranucci R. Bezbunková DNA: aplikácie pri rôznych chorobách. Bezbunková DNA ako diagnostické markery. Springer; 2019.
2. Nikolaev S, Santoni F, Garieri M, a kol. Extrachromozomálne riadiace mutácie pri glioblastóme a glióme nízkeho stupňa. Nat Commun. 2014;5:1–7.
3. Weerakoon KG, McManus DP. Bezbunková DNA ako diagnostický nástroj pre ľudské parazitárne infekcie. Trendy Parasitol. 2016;32:378–391.
4. Lv W, Pan X, Han P, a kol. Circle-Seq odhaľuje genómové a chorobne špecifické znaky v extrachromozomálnych kruhových DNA bez močových buniek. Clin Transl Med. 2022;12:e817.
5. Henriksen RA, Jenjaroenpun P, Sjøstrøm IB, a kol. Kruhová DNA v ľudskej zárodočnej línii a jej spojenie s rekombináciou. Mol Cell. 2022;82:209–217.e27.
6. Møller HD, Mohiyuddin M, Prada-Luengo I, a kol. Kruhové prvky DNA chromozomálneho pôvodu sú bežné v zdravom ľudskom somatickom tkanive. Nat Commun. 2018;9:1–12.
7. Ling X, Han Y, Meng J a kol. Malá extrachromozomálna kruhová DNA (eccDNA): hlavné funkcie v evolúcii a rakovine. Mol Cancer. 2021;20:1–15.
8. Kuscu C, Kiran M, Mohammed A, a kol. Integračné analýzy cirkulujúcich malých RNA a transkriptómu obličkového štepu pri transplantačnej glomerulopatii. Int J Mol Sci. 2021;22:6218.
9. Lee SI, Park H, Kim SJ a kol. Profilovanie cirkulujúcej RNA v postreperfúznej plazme od príjemcov transplantácie obličky. Transplant Proc. 2021;53:2853–2865.
10. Cheng TH, Jiang P, Tam JC a kol. Genomické bisulfitové sekvenovanie odhaľuje pôvod a časovo závislú fragmentáciu močovej cfDNA. Clin Biochem. 2017;50:496–501.

Viac informácií: david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

Tiež sa vám môže páčiť