Úloha BATF3 v diferenciácii Tu9 a patológiách L MucOsal poháňaných T-bunkami (2. časť)

Ak sa chcete dozvedieť viac informácií, kontaktujte prosímdavid.wan@wecistanche.com

DISKUSIA

Bunky T#9 sú dôležité pre rozvoj zápalových a alergických ochorení. Avšak transkripčný program a zápalové spúšťače, ktoré riadia diferenciáciu buniek TH9, zostávajú neúplne pochopené. V tejto štúdii sme identifikovali prozápalový cytokín TL1A ako silný induktor myšacej a ľudskej T-9 diferenciácie a identifikovali sme BATF3 ako dôležitý transkripčný faktor zapojený do diferenciácie buniek TH9. Transkripčná sieť, ktorá bola indukovaná TL1A, zahŕňala transkripčné faktory BATF a BATF3 a niekoľko génov regulovaných BATF (doplnkový obrázok 7). In vivo, v experimentoch s adoptívnym prenosom,Bunky Tμ9-TL1Aboli vysoko prozápalové, čo viedlo k zápalu čriev a pľúc. Prozápalový sklon buniek T-9-TL1A bol závislý od produkcie IL-9. Prenosy buniek Batf3-/T a 9-TL1A viedli k zníženiu zápalu slizníc a expresii cytokínov in vivo.

Hoci bunky Tμ9 boli identifikované ako odlišná pomocná podskupina T, transkripčný faktor, ktorý pôsobí ako hlavný regulátor alebo iba identifikuje fenotyp TH9, nebol identifikovaný. Namiesto toho niekoľko transkripčných faktorov pôsobí v zhode pri regulácii diferenciácie T-9 buniek. Ukázalo sa, že BATF funkčne spolupracuje s IRF4 a viaže sa na kompozitné prvky v promótorových oblastiach responzívnych génov. BATF spolu s IRF4 nedávno navrhnuté ako „priekopnícke faktory“ v diferenciácii buniek Tp17 tým, že prispievajú k počiatočnej dostupnosti chromatínu a uľahčujú prístup iných transkripčných faktorov.36 Zistili sme, že TL1A má priamy vplyv na expresiu BATF a synergizuje s TGF{{9} } a IL-4 na maximálnu indukciu expresie BATF najmä na začiatku diferenciácie TH9. Na podporu tejto predstavy stimulácia samotným TL1A vedie k väzbe BATF na promótor II9, zatiaľ čo nemá žiadny priamy vplyv na väzbu iných transkripčných faktorov (IRF4 a BATF3). všakTH9-TL1Apodmienky synergicky zvyšujú väzbu BATF3 a IRF4, ako aj acetyláciu histónu H3, permisívnu modifikáciu chromatínu, ktorá koreluje s aktivitou promótora 119.14 V súlade s predtým publikovanými údajmi je BATF potrebný na expresiu IL-9 a IL-10 za podmienok T,9.15 TL1A je aspoň čiastočne schopný prekonať požiadavku BATF pri indukcii IL-9 a IL-13 s najväčšou pravdepodobnosťou zlepšením inej transkripcie faktory, ktoré by mohli byť schopné kompenzovať stratu BATF. Jedným kandidátom na funkčnú kompenzáciu je BATF3, ktorý je transkripčne indukovaný TL1A. Navrhlo sa, že BATF a BATF3 sú funkčne zameniteľné pre vývoj Tu17 a Tp2 a nadmerná expresia BATF3 v BATF-'- T bunkách môže obnoviť produkciu IL-17 v bunkách TH17 a IL-4 a IL{{ 23}} produkcia v T#2 bunkách.18323738 Avšak úloha BATF3 vo vývoji Tu buniek za fyziologických podmienok a potenciálna interakcia medzi BATF a BATF3 počas diferenciácie TH9 nebola definovaná. Tu demonštrujeme, že TL1A uľahčuje väzbu BATF3 na promótor 119. Ako funkčný dôsledok prispieva BATF3 k produkcii IL-9 v podmienkach T-9, najmä v kontexte stimulácie TL1A. Prekvapivo je BATF3 na včasnú diferenciáciu buniek Tu9 nepostrádateľný, ale môže byť potrebný na stabilizáciu alebo udržanie fenotypu TA9 a sekrécie IL-9 v neskorších časových bodoch. Naše zistenia o úlohe BATF3 v diferenciácii TH9 sú v protiklade s predchádzajúcimi správami o tom, že BATF3 je postradateľný pre diferenciáciu Tu1, TA2 a Tu17.2'3'Na rozdiel od BATF, BATF3 prispieva iba k sekrécii IL{49}} a nie na iné cytokíny TH9, ako sú IL-10 a IL-13, čo naznačuje, že BATF3 sa špecificky viaže na promótor 119 a indukuje sekréciu IL{55}}. Na určenie ďalších cieľových génov BATF3 počas diferenciácie TH9 a jeho úlohy v iných podskupinách Tu sú potrebné ďalšie štúdie.

Kliknutím sem sa dozviete viac o Cistanche

Obr. 7 Nedostatok Batf3 vedie k zníženému zápalu sliznice vyvolanému bunkami TH9-TL1A. Naivné bunky WTor Batf3-/bunky boli diferencované na bunky T_9-TL1A a injikované myšiam Rag1-7. a Reprezentatívne H&E farbenia pľúc (horné panely) a hrubého čreva (spodné panely). Mierka: 200 mm. b Histologické skóre pre pľúca.c Celkový počet buniek (vľavo, v strede), frekvencia CD4* T buniek (vpravo). Údaje predstavujú priemer ± SD.n=10/skupina.d Intracelulárne farbenie IL{{11} }, IL-13 a IL-17 zo sleziny, MLN a pľúc po ex vivo restimulácii s PMA plus lonomycín. Údaje predstavujú priemer ± SD.n=5/skupina. Je znázornený jeden reprezentatívny experiment z troch nezávislých experimentov.*s<0.05,><0.01 as="" determined="" by="" student's="">

Hoci bolo opísané, že iné prozápalové cytokíny alebo mediátory, ako sú IL-1, OX40 a TSLP, zvyšujúTH9 diferenciáciaZdá sa, že TL1A je jedinečný pri upregulácii BATF, čím otvára chromatín pre nábor ďalších transkripčných faktorov vrátane BATF3.353940 Naše údaje o sekvenovaní RNA podporujú tento záver identifikujúci podskupinu génov závislých od BATF výrazne upregulovaných pomocou TL1A. Okrem toho naše údaje o sekvenovaní RNA odhaľujú, že BATF3 reguluje aktivitu transkripčných faktorov, bunkovú proliferáciu a transdukciu intracelulárneho signálu, čo naznačuje dôležitú úlohu BATF3 počas diferenciácie T#9. In vivo bunky Batf3-'-TA9-TL1A viedli k zníženiu zápalu slizníc a expresii cytokínov. Nepozorovali sme zhoršenú migráciu buniek Batf3-'-TH9-TL1A do čreva, čo je na rozdiel od BATF-'- CD4 plus T buniek, ktoré nedokážu upregulovať markery migrácie čreva a nie osídľujú črevá.4' Naše údaje podporujú úlohu BATF3 v patofyziologickej funkcii buniek TA9-TL1A.

Bunky IL-9 a TA9 boli nedávno spojené s patogenézou IBD.*-10 IL-9 plus CD4 plus T bunky boli obohatené u pacientov s UC a vysokými hladinami IL v sére{{ 5}} koreloval so závažným ochorením u pacientov s CD.{6}}V experimentálnom modeli hapténom vyvolaného ochorenia podobného UC sú IL-9-a PU.1-myši s deficitom chránené pred črevným ochorením zápal a protilátky anti-IL{12}} chránia v modeli chronickej prevencie. stupeň Nepozorovali sme však žiadne účinky TL1A na expresiu PU.1 v podmienkach T9. Ukázali sme, že stimulácia TL1A vedie k zvýšenej regulácii BATF a BATF3, ale nie PU.1. Hoci PU.1 bol opísaný ako hlavný regulátor diferenciácie TH9, je potrebný len na expresiu podskupiny génov TH9 a myší. čo naznačuje, že väzba PU.1 sa nemení v úplnej nezávislosti PU.1 a BATF od BATF. 75

Ukázali sme, že bunky T,{0}}TL1A sú vysoko patogénne in vivo a vyvolávajú zápaly čriev a pľúc. Črevný zápal vTH9-TL1Apríjemcov bol obmedzený hlavne na tenké črevo. Okrem toho sme pozorovali zvýšený počet buniek CCR6* a CD103 u príjemcov TH9-TL1A in vivo. Tieto údaje konzistentne preukazujú, že chemokínový receptor CCR6 a integrín CD103 sú exprimované na bunkách TH9 a uľahčujú migráciu do zápalových miest a slizničných povrchov.15,42 Zvýšený počet buniek CCR6 plus u príjemcov Tμ9-TL1A in vivo je v súlade s naším pozorovaním zápalu hlavne tenkého čreva, pretože sa ukázalo, že os CCR6/CCL20 špecificky uľahčuje migráciu buniek T,17 do tenkého čreva a je pravdepodobné, že podobné mechanizmy platia aj pre bunky Tμ9.3 Naše zistenia sú tiež konzistentné s nedávnymi nálezmi zvýšených sérových hladín IL-9 u pacientov s CD, najmä so závažnými ochoreniami.

TL1A zvyšuje diferenciáciu T,1, TH2 a TA17 a hoci sme nevideli žiadny náznak globálneho posunu z buniek T9 do iných podskupín TH in vitro, mohlo by to naznačovať, že bunky TH9 diferencované s TL1A môžu byť nestabilné in vivo a „trans“. -diferencovať“ do iných podmnožín. Potenciál trans-diferenciácie buniek TH9 bol kontroverzný a môže závisieť od kontextu, modelu ochorenia a imunitného stavu hostiteľa. V EAE dochádza k trans-diferenciácii TH9 na bunky produkujúce IFN-Y, zdá sa však, že fenotyp T,9 je v modeloch rakoviny stabilný.339 Prekvapivo in vivo T9-TL1A bunky naďalej produkovali IL{ {18}} a downstream cytokínov, ako sú IL-17 a IL-13 a netrans-diferencovali sa. Túto predstavu podporujú aj naše údaje, ktoré ukazujú, že samotná liečba anti-1L-9 postačuje na blokovanie patogénnych účinkov buniek T9-TL1A. Samotná liečba protilátkou anti-Lil{27}} znížila produkciu IL{28}} a zmiernila zápal čriev a pľúc späť na úroveň TH9. Rozvoj alergického zápalu pľúc si vyžaduje spojenie buniek TH2 a TH9. Zdá sa však, že náš model chronického, nealergického zápalu pľúc je poháňaný najmä IL-9-produkujúcimi bunkami T.9, aj keď nemôžeme vylúčiť podiel IL-9-produkujúcich ne-T buniek v patogenéze v našom Model.

Stručne povedané, TL1A je silným induktorom diferenciácie myších a ľudských T9 a objasnili sme zahrnuté signálne dráhy. Vzhľadom na prozápalové vlastnosti bunky TH9-TL1A in vivo môže byť zacielenie na os TL1A-BATF3-IL-9 sľubným terapeutickým prístupom v prípade patológií vyvolaných T19- ako je IBD alebo alergické ochorenie pľúc.

METÓDY

Myši C57BL/6, C57BL/6 Rag1-/, B6.SJL-Ptprc" Pepc/BoyJ(CD45.1),(B6.Cg-Nfkb1*m130l/J), Stat 6-/-(B6.129S2(C)-Stat6"miGr"/J), p50-/-B6.Cg-Tg(TcraTcrb)425Cbn/ (OT-I),Batrf/( Myši B6.129s-Batm1,1kmm/) a Bat3-/(B6.129 S(C)-Batf3m1km"/) boli zakúpené od laboratória Jackson Laboratory. Myši Dr3-/- n boli opísané inde.4 Myši boli udržiavané v podmienkach SPF. Všetky štúdie na zvieratách boli schválené Výborom pre starostlivosť a používanie zvierat Cedars-Sinai Medical Center. Izolácia a diferenciácia T-buniek Naivné T-bunky (CD62LhichcD44'o"CD25~; klony MEL-14, IM7, PC61.5; eBioscience) boli izolované zo sleziny a MLN pomocou EasySeptM Mouse CD4 plus Isolation Kit (Stem Cell technológie) nasledované triedením buniek (MoFlo, Beckman Coulter). Bunky sa kultivovali v médiu RPMI-1640 (10 percent FBS) s anti-CD3s (145-2C11;BD Biosciences), anti-CD28(37,51 ; eBioscience) (podmienky TH0) a myšací TL1A (100 ng/ml; R&D Systems) za podmienok T-9 (ľudský TGF- 1 [3 ng/ml], Biolegend, IL{{66} } [20 ng/ml, PeproTech).Po 2 dňoch sa pridal IL-2(20 U/ml). Na vyhodnotenie bunkovej proliferácie sa triedené bunky označili sukcínimidylesterom karboxyfluoresceínu (CFSE; Invitrogen), diferencovaným na 5 dní a riedenie CFSE sa hodnotilo prietokovou cytometriou. Na vyhodnotenie diferenciácie T,9 špecifickej pre antigén boli naivné CD4 plus T bunky z myší OT-II stimulované počas 3 dní s 1 ug/ml OVA;23-339 peptid v prítomnosť syngénnych APC (pomer 1:3). e pripravené depléciou CD90.2T buniek zo splenocytov (Stem Cell Technologies), po ktorej nasleduje ošetrenie mitomycínom C. izolácia ľudských CD4 plus T buniek a diferenciácia Krv bola získaná od zdravých dobrovoľníkov po informovanom súhlase v súlade s postupmi stanovenými Cedars-Sinai Institutional Review Board (IRB # 3358, 2673). Naivné CD4 plus T bunky (CD4 plus CD25-CD45RA plus CD45RO7) boli izolované z PBMC pomocou EasySepl Human CD4 T cell Enrichment Kit (Stem Cell Technology), po čom nasledovalo triedenie buniek. Bunky sa kultivovali s anti-CD3 (5 ug/ml) a anti-CD28 (2 ug/ml) s ľudským TL1A (100 ng/ml; Fitzgerald) za podmienok TH9 (ľudský TGF{103}} [5 ng/ml] ľudský IL{105}} [10 ng/ml]). ELISA Koncentrácia cytokínov v kultivačných supernatantoch bola testovaná pomocou ELISA na myšací alebo ľudský IL{107}}, IL{108}} a IL{109}} (eBioscience). Intracelulárne farbenie Bunky boli restimulované 50 ng/ml PMA (forbol 12-myristát 13-}acetát), 500 ng/ml ionomycínu a monenzínu (eBioscience) počas 4 hodín, zafarbené anti-CD4 (RM{{{{101} 117}}, eBioscience), fixovaný a permeabilizovaný pomocou farbiaceho pufra FoxP3 (eBioscience) a zafarbený protilátkami proti myšiemu IL-9 (RM9A4, BioLegend),IL-10(JES{123} }E3),IL-13(13A),IL{127}}A (eBio17B7), IL{130}}F (eBio18F10),IFN-y(XMG1.2),IL{136} } (BVD6-24G2),IL{139}} (1H8PWSR),Ki67(SolA15),BATF(MBM7C7), IRF4 (3E4),ľudský IL-9(MH9A4, všetky eBioscience), a BATF3 (841792, R&D Systems). Vzorky sa analyzovali pomocou prietokového cytometra CyAnADP (Dako Cytomation) a softvéru FlowJo (TreeStar Inc.).

Kvantitatívna RT-PCR

Celková RNA sa izolovala pomocou súprav RNeasy a reverzne sa transkribovala do cDNA súpravou Omniscript RT (obe Qiagen).qPCR sa uskutočnilo pomocou systému Mastercycler" ep realplex² (Eppendorf). Platinové kvantitatívne PCR SuperMix-UDG (Invitrogen) a sondy a priméry TaqMan boli použité pre Actb, I9, I10, 13 a BATF （IDT）） (doplnková tabuľka 7）. RT2 SYBR „Zelený qPCR Mastermix (Qiagen) a sady primérov sa použili pre Actb a Batf3 (IDT). Expresia mRNA cieľových génov bola normalizovaná na expresiu Actb. Touto metódou sa vypočítala relatívna génová expresia.

2-imunoprecipitácia AACt Chromatin

Chloe sa uskutočnila s použitím súpravy na imunoprecipitáciu chromatínu EZ ChIP (Millipore), po ktorej nasledovala analýza qPCR. Celkovo sa stimulovalo, fixovalo, sonikovalo a imunoprecipitovalo 1 x 10 stupňov buniek pomocou 2 ug protilátok triedy ChIP: anti-BATF(sc-100974),anti-BATF3(sc-162246),normálna myš lgG(sc-2025), anti-IRF4(sc-6059), normálny kozí lgG(sc-2028)(všetky Santa Cruz Biotechnology), anti-acetyl-histón H3({{17 }}) a normálny králičí IgG (Milli-pore). Imunoprecipitovaná DNA bola reverzne zosieťovaná, purifikovaná pomocou rotačných kolón a analyzovaná pomocou qPCR (sekvencie primérov: doplnková tabuľka 7). Na kvantifikáciu imunoprecipitovanej DNA sme vytvorili štandardnú krivku zo sériových riedení vstupnej DNA. Údaje sú prezentované ako percento vstupnej DNA na základe normalizácie voči množstvu vstupnej DNA.

Sekvenovanie RNA (prístupové čísla GEO: GSE60362 a GSE106926)

Nízko vstupná RNA-Seg (TH9 vs. TH9-TL1A): Na vytvorenie dvojvláknových cDNA knižníc od 1,5 do 2,5 ng celkovej RNA z každej vzorky sa použila súprava Clontech SMARTer Ultra „Low Input RNA Kit for Sequencing v3 podľa odporúčaní výrobcu. Knižnice dvojvláknovej cDNA boli jednotlivo fragmentované a ligované pomocou adaptérov čiarových kódov lon Torrent lon Xpress" s použitím súpravy knižníc fragmentov lon Xpress" Plus s obmedzenými úpravami vrátane finálnych knižníc vybraných podľa veľkosti s vyčistením dvoch guľôčok a objemom V RNA-Seq knižnice boli hodnotené na koncentráciu a dĺžku pomocou Invitrogen's QubitdsDNA HS Assay Kit a AgilentSúprava DNA s vysokou citlivosťou, respectively. Samples were multiplexed to obtain >10 miliónov prečítaní na sekvenovanie. Združené knižnice boli amplifikované na lon Sphere" a sekvenované pomocou lon PIM Sequencing 200 Kit v2, lon Torrent".

mRNA-Seg (WT vs.Baft3-7T,9-TL1A): Illumina TruSeq Stranded mRNA library preparation kit was employed for RNA-Seq. Of total RNA, 1 ug per sample was used for poly-A mRNA selection using streptavidin-coated magnetic beads. cDNA was synthesized from enriched and fragmented RNA using reverse transcriptase (Super-Script ll, Invitrogen) and random primers. The cDNA was converted into double-stranded DNA, and enriched with PCR for library preparation. The PCR-amplified library was purified using Agencourt AMPure XP beads(Beckman Coulter). The concentration of the amplified library was measured with a NanoDrop spectrophotometer and on an Agilent 2100 Bioanalyzer. Samples were multiplexed to obtain >20 miliónov čítaní/vzorka a sekvenované na platforme NextSeq 500 (Illumina) pomocou 75-bp jednokoncového sekvenovania.

Analýza dát. Nespracované čítania boli filtrované a orezané súpravou nástrojov FASTX (http://hannonlab.cshl.edu/fastx{{0}}toolkit/) a zarovnané pomocou Tophat verzie 2.0.8 s UCSC anotácia referenčného genómu myši GRCm38/mm10 (http://genome.ucsc.edu). Počty čítaní génov boli generované pomocou HTSeq (v0.5.4) a potom normalizované skráteným priemerom metódy normalizácie M-hodnôt s edgeR (v3.0.8) v Bioconductor v R(v2.15), ktorý používa vážený skrátený priemer logaritmické pomery expresie. Pre všetky analýzy sa použili iba signály kvality (prah: desať impulzov na milión v najmenej dvoch zo štyroch vzoriek). Uskutočnila sa analýza bez dozoru s použitím 100 najlepších génov zoradených podľa medzikvartilového rozsahu a potom sa pomocou (v2.11) vytvorilo hierarchické zhlukovanie s použitím dvojcestných Pearsonových korelácií na vizualizáciu nezaujatých vzorov pervazívnej génovej expresie. Na určenie diferenciálnych výrazov medzi TH9 a T sa použila riadená analýza s použitím modifikovaného Fisherovho presného testu v edgeR a medznej hodnoty chybného objavenia 10 percent pomocou postupu Benjaminiho a Hochberga.{21}}TL1A alebo WT a Batf{{23} }T,9-TL1A. Analýza obohatenia dráhy sa uskutočnila pomocou DAVID6.7 (http://david.abcc.ncifcrf.gov/) s prahovou hodnotou počítadla =5 a prahom skóre poľahčenia=0 0,05.

Model prenosu T-buniek

CD4 plus CD62LighcD44"cD25- T bunky z myší CD45.1 boli diferencované na T9 alebo T,9-TL1A bunky počas 3 dní. Samce Rag{{10}}/príjemca myši dostali ip injekciu 0,5 × 10 stupňov TH9 alebo TH9-TL1A buniek. Myši sa vážili 6-8 týždňov. Na neutralizačné experimenty sa myšiam ip injikovala anti-IL-9 alebo kontrola lgG2b protilátka (obe 50 ug/dávka; R&D Systems) trikrát týždenne počas 4 týždňov a dvakrát týždenne počas zostávajúceho času počnúc dňom prenosu T-buniek. Tkanivá boli fixované vo formalíne, zaliate do parafínu a zafarbené H&E alebo AB-PAS. Zápal bol hodnotený semikvantitatívnym bodovacím systémom vyškoleným patológom zaslepeným experimentálnymi podmienkami.45,46 LPMC sa izolovalo z hrubého čreva, ako už bolo opísané.7 Pľúcne tkanivo sa trávilo 45 minút pri 37 °C 10 ml HBSS obsahujúceho 15 ug/ml Liberase“ (Roche) a 25 ug/ml DNázy I （Sigma) a prefiltrovanie cez 40-μm bunkové sitko s následnou lýzou červených krviniek. Jednobunkové suspenzie boli zafarbené anti-CD4, anti-CD45.1(A20), anti-CCR6 (29-2L17) a anti-CD103(2E7, všetky eBioscience) a anti-Ki{{52 }} (SolA15, BD PharMingen) protilátky na prietokovú cytometriu alebo restimulované s anti-CD3c/anti-CD28 protilátkami počas 3 dní. Hladiny cytokínov v supernatantoch sa merali pomocou ELISA.

Štatistiky

Štatistická významnosť sa vypočítala pomocou softvéru SPSS (IBM SPSS Statistics 20, IBM Machines Corp., Armonk, NY, USA). Dáta sa analyzovali pomocou jednosmernej analýzy rozptylu (ANOVA), po ktorej nasledoval post hoc nepárový dvojstranný Studentov t-test alebo Mann-Whitney U test, ako je uvedené. Rozdiely boli považované za významné na str<>

POĎAKOVANIE

Táto práca bola podporovaná NIH (DK056328 pre SRT) a nadáciou F. Widjaja (SRT a KSM). Anita Vibsig Neutzsky-Wulff získala postdoktorandské štipendiá od The Carlsberg Foundation (Dánsko) a Lundbeck Foundation (Dánsko). Jordan Nunnelee získal ocenenie Student Research Award od Crohn's and Colitis Foundation of America. Biobanku Cedars-Sinai MIRIAD IBD podporuje Nadácia F. Widjaja Foundation Inflammatory Bowel and Immunobiology Research Institute, NIH/NIDDK granty P01 DK046763, U01 DK062413 a The Leona M and Harry B Helmsley Charitable Trust.

AUTORSKÉ PRÍSPEVKY

MT, HH, LT, MW, BS, MW, BS, MW, JN, JS, AN-W, RB, YW, JT, VF a KM. vykonal experimenty, analyzoval údaje a kriticky preskúmal rukopis. AP, J. T a YW vykonali analýzu údajov RNA-Seq. MT, ST a KM navrhli experimenty. Rukopis napísali MT a KM.

ĎALŠIE INFORMÁCIE

Online verzia tohto článku (https://doi.org/10.1038/s41385-018-0122-4) obsahuje doplnkový materiál, ktorý je k dispozícii oprávneným používateľom.

Konkurenčné záujmy: Autori nedeklarujú žiadne konkurenčné záujmy.

Poznámka vydavateľa: Springer Nature zostáva neutrálny, pokiaľ ide o jurisdikčné nároky v publikovaných mapách a inštitucionálnych pridruženiach.

LITERATÚRA

1. Dardalhon, V. a kol. IL-4 inhibuje TGF-beta-indukované Foxp3 plus T bunky a spolu

s TGF-beta generuje IL-9 plus IL-10 plus Foxp3(-) efektorové T bunky. Nat. Immunol. 9, 1347-1355(2008).

2. Veldhoen, M. a kol. Transformácia rastového faktora beta „preprogramuje“ rozdielne

iniciáciu T pomocných 2 buniek a podporuje podskupinu produkujúcu interleukín 9-. Nat. Immunol.9,1341-1346 (2008).

3. Jager,A, Dardalhon,V,Sobel, RA, Bettelli,E.&Kuchroo, VK Th1, Th17 a Th9

efektorové bunky indukujú experimentálnu autoimunitnú encefalomyelitídu s rôznymi patologickými fenotypmi.J.Immunol.183,7169-7177(2009).

4. Licona-Limon, P. a kol. Th9 bunky riadia imunitu hostiteľa proti gastrointestinálnemu traktu

infekcia červami. Imunita 39,744-757(2013).

5. Purwar, R. a kol. Silná nádorová imunita voči melanómu sprostredkovaná interleukínom-9-

produkujúce T bunky. Nat. Med. 18, 1248-1253 (2012).

6. Gerlach, K. a kol. TH9 bunky, ktoré exprimujú transkripčný faktor PU.1 poháňajú T bunky-

sprostredkovaná kolitída prostredníctvom signalizácie receptora IL{0}} v bunkách črevného epitelu. Nat Immunol.15,676-686(2014).

7. Nalleweg, N. a kol. IL-9 a jeho receptor sa podieľajú prevažne na

patogenéza UC. Gut.64,743-755 (2015).

8. Feng, T. a kol. Hladiny interleukínu 9 v sére predpovedajú závažnosť ochorenia a klinický stav

účinnosti infliximabu u pacientov s Crohnovou chorobou. Inflamm. Bowel Dis. 23, 1817-1824(2017).

9. Matusiewicz,M., Neubauer,K,Bednarz-Misa,I, Gorska,S.&Krzystek-Korpacka,M.

Systémový interleukín-9 pri zápalovom ochorení čriev: spojenie s hojením sliznice pri ulceróznej kolitíde. World J. Gastroenterol. 23,4039-4046(2017).

10. Obžalovaný C. a spol. Význam sérových hladín II-9 v zápalovom čreve

choroba. Int. J. Immunopathol. Pharmacol. 28, 569-575 (2015).

11. Jash, A. a kol. Permisívny nukleárny faktor aktivovaných T buniek 1 (NFAT1).

modifikácia chromatínu uľahčuje transaktiváciu interleukínu -9 (IL-9) sprostredkovanú jadrovým faktorom kappaB (NF-kappaB). J. Biol. Chem. 287,15445-15457(2012). 12. Staudt, V. et al. Interferón-regulačný faktor 4 je nevyhnutný pre vývoj

program pomocných T buniek 9. Imunita 33, 192-202 (2010).

13. Goswami, R. a kol. STAT6-závislá regulácia vývoja Th9.J. Immunol.

188,968-975(2012).

14. Chang, HCet al. Pre rozvoj je potrebný transkripčný faktor PU.1

IL-9-produkujúce T bunky a alergický zápal. Nat. Immunol. 11, 527-534 (2010).

15. Jabeen, R. a kol. Vývoj Th9 buniek vyžaduje transkripciu regulovanú BATF

siete. J. Clin. investovať. 123,4641-4653(2013).

16. Kaplan, MH Sieť transkripčných faktorov v Th9 bunkách. Semin. Imunopathol.

39,11-20(2017).

17. Echlin, DR, Tae, HJ, Mitin, N. & Taparowsky, EJB-ATF funguje ako negatív

regulátor AP-1 sprostredkovanej transkripcie a blokuje bunkovú transformáciu Ras a Fos. Oncogene 19, 1752-1763 (2000).

18. Murphy, TL, Tussiwand, R. & Murphy, KM Špecifickosť prostredníctvom spolupráce:

Interakcie BATF-IRF riadia imunitno-regulačné siete. Nat. Rev. Immunol. 13,499-509(2013).

19. Sopel, N., Graser, A., Mousset, S. & Finotto, S. Transkripčný faktor BATF

moduluje cytokínmi sprostredkované odpovede v T bunkách. Cytokine Growth Factor Rev. 30,39-45 (2016).

20. Edelson, BT a kol. Periférne CD103(plus) dendritické bunky tvoria jednotnú podskupinu

vývojovo príbuzný CD8 alfa(plus) konvenčným dendritickým bunkám.J. Exp. Med. 207,823-836(2010).

21. Hildner, K. a kol. Nedostatok Batf3 odhaľuje rozhodujúcu úlohu pre CD8alfa＋ dendritikum

bunky v cytotoxickej T bunkovej imunite. Science 322,1097-1100 (2008).

22. Meylan, F. a kol. Receptor DR3 rodiny TNF je nevyhnutný pre rôzne T bunky

sprostredkované zápalové ochorenia. Imunita 29,79-89 (2008).

23. Fang, L, Adkins, B, Deyev, V. & Podack, ER Základná úloha TNF receptora

nadrodina 25 (TNFRSF25) pri rozvoji alergického zápalu pľúc. J. Exp.Med.205,1037-1048(2008).

24. Pappu, BP a kol. Interakcia TL1A-DR3 reguluje funkciu buniek Th17 a Th17-

sprostredkované autoimunitné ochorenie. J. Exp. Med. 205,1049-1062 (2008).

25. Bull, MJ a kol. Poháňa dráhu receptora smrti 3-proteínu 1A podobného TNF

nepriaznivá kostná patológia pri zápalovej artritíde.J. Exp.Med. 205,2457-2464 (2008).

26. Thomas, LS a kol. Člen rodiny TNF TL1A indukuje sekréciu IL-22 v

odovzdané ľudské Th17 bunky prostredníctvom IL-9 indukcie. J. Leukoc. Biol. 101,727-737 (2017).

27. Richard, ACet al. Ligand TNF rodiny TL1A a jeho receptor DR3 podporujú T

alergická imunopatológia sprostredkovaná bunkami zvýšením diferenciácie a patogenity IL-9-produkujúcich T buniek.J.Immunol.194,3567-3582(2015). 28. Tan, C. a kol. Antigénovo špecifické Th9 bunky vykazujú jedinečnosť vo svojej kinetike

produkciu cytokínov a krátku retenciu v mieste zápalu. Immunol. 185,6795-6801(2010).

29. Wilhelm, C. et al. Reportér osudu IL{1}} demonštruje indukciu vrodenej IL-

9 odpoveď pri zápale pľúc. Nat. Immunol. 12, 1071-1077 (2011).

30. Banias, G. et al. Úloha TL1A a jeho receptora DR3 v dvoch modeloch chronickej

myšia ileitída. Proc. Natl Acad. Sci. USA 103, 841-8446 (2006).

31. Betz, BCet al. BATF koordinuje viacero požadovaných aspektov funkcie B a T buniek

pre normálne protilátkové reakcie.J. Exp.Med. 207,933-942(2010).

32. Schraml, BU a kol. Transkripčný faktor AP-1 BATF riadi rozdiel T(H)17-

zasvätenie. Nature 460, 405-409 (2009).

33. Glasmacher, E. a kol. Genomický regulačný prvok, ktorý riadi zostavovanie a

funkcie imunitne špecifických AP-1-IRF komplexov. Science 338,975-980 (2012). 34. Li, P. a kol. BATF-JUN sú rozhodujúce pre transkripciu sprostredkovanú IRF v T bunkách. Príroda

490,543-546(2012).

35. Yao, W. et al. Interleukín-9 je potrebný na alergický zápal dýchacích ciest sprostredkovaný

cytokínom TSLP.Immunity 38,360-372 (2013).

36. Ciofani, M. a kol. Overená regulačná sieť pre špecifikáciu buniek Th17. Bunka

151,289-303(2012).

37. Tussiwand, R. et al. Kompenzačný vývoj dendritických buniek sprostredkovaný BATF-

IRF interakcie. Nature 490, 502-507(2012).

38. Iwata, A. a kol. Kvalita signalizácie TCR určená diferenciálnymi afinitami

zosilňovače pre kompozitný komplex transkripčného faktora BATF-IRF4. Nat. Immunol.18,563-572(2017).

39. Vegan, F. a kol. Transkripčný faktor IRF1 diktuje IL -21-závislú

protirakovinové funkcie buniek TH9. Nat. Immunol. 15,758-766(2014).

40. Xiao, X. a kol. Signalizácia OX40 podporuje indukciu T(H)9 buniek a dýchacích ciest

zápal. Nat. Immunol. 13, 981-990 (2012).

41. Wang, C. a kol. BATF je potrebný na normálnu expresiu gut-homing

receptory pomocnými T bunkami v reakcii na kyselinu retinovú. J. Exp. Med. 210, 475-489(2013).

42. Kara, EE a kol. Odlišné osi chemokínových receptorov regulujú prenos buniek Th9

na alergické a autoimunitné zápalové miesta. J. Immunol. 191,110-117 (2013).

43. Esplugues, E. et al. Kontrola buniek TH17 prebieha v tenkom čreve. Príroda 475,

514-518(2011).

44. Shih, DQ a kol. Bola stanovená inhibícia nového fibrogénneho faktora Tella

fibróza hrubého čreva. Mucosal Immunol.7,1492-1503 (2014).

45. Ostanin, DV a kol. Model prenosu T buniek chronickej kolitídy: koncepty, úvahy a triky obchodu. Am. J. Physiol. Gastrointestinálny test. Pečeň Physiol. 296, G135-G146 (2009).

46. ​​Chin, JEet al. Nábor leukocytov v dýchacích cestách u myší závisí od alfa4-

integríny a molekula adhézie vaskulárnych buniek-1. Am. J. Physiol. 272, L219-L29 (1997).

47. Weigmann, B. a kol. Izolácia a následná analýza myšacej lamina propria

mononukleárne bunky z tkaniva hrubého čreva. Nat. Protoc. 2, 2307-2311 (2007).