Nový rok, nový variant SARS-CoV{1}}: Uznesenia týkajúce sa protokolov genomického sledovania, ktorým bude spoločnosť Omicron čeliť

Kontakt:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Vznik variantov SARS-CoV-2 so zvýšenou a čiastočnou prenosnosťouimúnnyúnik (známy aj ako Variants of Concern, VOC) charakterizoval druhý rok pandémie COVID-19. Genomický dohľad umožňuje identifikovať skryté, rýchlo sa šíriace línie a VOC skôr, ako sa stanú hrozbou pre verejné zdravie. Čílsky inštitút verejného zdravia (Instituto de Salud Publica, ISP) viedol iniciatívy na sledovanie genómu SARS-CoV-2 v Čile. Pomocou sekvenčných údajov ISP signalizoval zavedenie VOC a charakterizoval ich prenosnosť a mutačné podpisy, čo prispelo k lepšiemu pochopeniu miestnych charakteristík pandémie.1

cistanche propiedades: čiastočnýimúnnyuniknúť

K 17. decembru 2021 sa novovzniknutý Omicron VOC rýchlo rozšíril do 89 krajín vrátane Čile.2 Do 21. decembra ISP identifikoval 119 vzoriek ako Omicron. Z toho 118 zodpovedá príletom na letisko SCL a jeden komunitnému prenosu (obrázok 1a, b). Hoci epidemiologické črty Omicron zostávajú v štádiu štúdia, súčasné správy naznačujú dva znepokojujúce fakty: Po prvé, Omicron má rozsiahly únik pred prirodzenou neutralizáciou aj očkovaním, čím zvyšuje šance na reinfekciu a prelomové infekcie.

výhody cistanche salsa

konkrétneOmikronová imunitaúnik by znížil účinnosť vakcíny proti symptomatickému ochoreniu na 35 percent a 73 percent v prípade 2x čerstvo zaočkovaných a posilnených jedincov, v uvedenom poradí, vzhľadom na mRNA vakcíny (BNT162b2 od Pfifizer-BioNTech).3 Okrem toho sa zdá, že táto ochrana pred infekciou v priebehu niekoľkých mesiacov slabne miera úniku je oveľa vyššia v prípade heterológnej preočkovania BNT162b2 u jedincov plne zaočkovaných inaktivovanou vírusovou vakcínou Sinovac, CoronaVac.4,5 Hoci k 9. januáru 2022 je 86,6 percent čílskej populácie plne zaočkovaných a 60,5 percento dostalo posilňovaciu dávku6 (obrázok 1c), väčšina podaných dávok zodpovedá CoronaVac (55,3 percenta), po ktorej nasleduje BNT162b2 (36,4 percenta, typicky posilňovacia dávka),7 teda riskuje ďalšiu vlnu.4

antokyanové doplnky a cistanche doplnky

Po druhé, na začiatku a pri absencii nových NPI dosiahol Omicron čas zdvojnásobenia 1.5- 3 dní,8 teda sa šíril rýchlejšie ako Delta VOC. To je však lepšie vysvetlené rozsiahlymi informáciami spoločnosti Omicronimúnnynamiesto prirodzeného zvýšenia základnej prenosnosti.9 Prísnejšie neziskové organizácie preto môžu prenos značne znížiť. Aj keď sa zdá, že ochrana pred závažným priebehom infekcií Omicron zostáva zachovaná, vysoký výskyt medzi populáciou ohrozuje správnu funkciu kritickej infraštruktúry, pretože veľká časť pracovnej sily by si vyžadovala testy a karanténu. Preto je pre informované rozhodovanie zásadné určiť cirkulujúce varianty a vlastnosti prostredníctvom genómového dohľadu.

Hoci genómový dohľad poskytuje snímku cirkulujúcich variantov a ich mutačných podpisov, jeho spoľahlivosť závisí od kvality protokolu odberu vzoriek. V nasledujúcom texte zhrňujeme oficiálne odporúčania pre genómový dohľad10 do štyroch jednoduchých pravidiel, ktoré je potrebné vziať do úvahy pre robustný protokol odberu vzoriek pre genómový dohľad SARS-CoV{2}}: pravidlá CARD:

1. Koordinované: Úsilie rôznych subjektov by malo byť centrálne riadené a harmonizované, aby sa predišlo skresleniu výberu, zabezpečila sa reprezentatívnosť, optimalizovalo prideľovanie zdrojov a štandardizovali sa protokoly odberu vzoriek. Tento subjekt by mal tiež zabezpečiť transparentnosť protokolov odberu vzoriek, ktoré by sa mali hlásiť spolu s informáciami o genóme do GISAID.

2. Adaptívne: Intenzita sekvenovania by sa mala zvýšiť, aby sa zabezpečilo lepšie rozlíšenie, keď je nový variant signalizovaný v POE a detegovaný v komunitnom prenose a mala by sa znížiť na svoju základnú rýchlosť, keď sa zistí dominancia variantu. Tvorcovia politiky tak môžu pôsobiť preventívne (pozri obrázok 1d).

3. Reprezentatívny: Protokoly odberu vzoriek by mali zachytávať priestorové heterogenity, zameriavať sa na rôzne etnografické skupiny, brať do úvahy potenciálne predsudky kolidérov (napr. ako odber vzoriek iba symptomatických alebo neočkovaných jedincov alebo z rovnakého reťazca nákazy) a byť úmerné aktuálnemu výskytu zachovať reprezentatívnosť. V krajinách ako Čile, kde sú mestské centrá riedko rozmiestnené, musí byť reprezentatívnosť zabezpečená na regionálnom základe.

4. Diferenciál: So vzorkami zozbieranými na i) miestach vstupu (POE) a ii) v strediskách dohľadu by sa malo zaobchádzať a analyzovať oddelene, keďže slúžia na rôzne účely. Po zistení nových hrozieb v POE by sa malo zvýšiť vzorkovanie komunity, aby sa presne zachytila ​​dynamika včasnej výmeny medzi variantmi.

Keďže sme už zistili Omicron v komunitnom prenose, čílski tvorcovia politík by mali dynamicky prispôsobovať prísnosť nefarmaceutických zásahov, aby zabránili jeho šíreniu, a zároveň ponúknuť posilňovacie mRNA vakcíny väčším frakciám populácie.11 V tejto fáze je pre pripravenosť a tvorcov politík kľúčový genómový dohľad. by sa nemalo zameriavať len na surfovanie po vlne, ale aj na učenie sa z nej. Celkovo máme väčšie šance na úspech, ak budeme správne hrať svoje KARTY.

zlepšiť imunitu pomocouprírodné liečivá

Referencie

1 Alebo ostica KY, Contreras S, Mohr SB, et al. Mutačné signatúry a prenosnosť SARS-CoV-2 gama a lambda variantov. arXiv predtlač arXiv:2108.10018. 2021.

2 Viana R, Moyo S, Amoako DG a kol. Rýchla epidemická expanzia variantu SARS-CoV-2 Omicron v južnej Afrike. Príroda. 2022.

3 Cele S, Jackson L, Khoury DS, a kol. Omicron značne, ale neúplne uniká neutralizácii Pfifizer BNT162b2. Príroda. 2021.

4 Perez-Then E, Lucas C, Monteiro VS a kol. Imunogenicita heterológnej posilňovacej dávky BNT162b2 u plne zaočkovaných jedincov s CoronaVac proti SARS-CoV-2 variantom Delta a Omicron: skúsenosti z Dominikánskej republiky. medRxiv. 2021.

5 Lu L, Mok BW, Chen L a kol. Neutralizácia SARS-CoV-2 Omikrónového variantu sérom od príjemcov vakcíny BNT162b2 alebo Coronavac. Clin Infect Dis. 2021:ciab1041.

6 Mathieu E, Ritchie H, Ortiz-Ospina E, a kol. Globálna databáza očkovaní proti COVID-19. Nat Hum Behav. 2021: 1–7.

7 168 stupeň informe epidemiologico, informe incidencia y gravedad de Casos covid-19 sagun antecedentes de Vacunacion a informe Estra tegia Nacional de Tta [Internet]. Departamento de Estadisticas a Informacion de Salud. [citované 13. januára 2022].

8 Torjesen I. Obmedzenia týkajúce sa Covid sa sprísňujú, pretože prípady Omicron sa zdvojnásobujú každé dva až tri dni. BMJ. 2021;375:n3051

9 Lyngse FP, Mortensen LH, Denwood MJ a kol. SARS-CoV-2 Omi cron Prenos VOC v dánskych domácnostiach. medRxiv. 2021 december

10 Svetová zdravotnícka organizácia. Pokyny pre sledovanie variantov SARS CoV-2. Dočasné vedenie. [Internet] 9. augusta 2021.

11 Bauer S, Contreras S, Dehning J, a kol. Uvoľnenie obmedzení pri tempe očkovania zvyšuje slobodu a chráni pred ďalšími vlnami COVID-19. PLoS Comput Biol. 2021;17:(9) e1009288